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QSAR模型内部和外部验证方法综述
  • ISSN号:0254-6108
  • 期刊名称:环境化学
  • 时间:2013.7.15
  • 页码:1205-1211
  • 分类:X131[环境科学与工程—环境科学]
  • 作者机构:[1]同济大学长江水环境教育部重点实验室,上海,200092, [2]同济大学化学系,上海,200092, [3]同济大学环境科学与工程学院,上海,200092
  • 相关基金:国家自然科学基金(21177097)资助;中国博士后科学基金(2012M520932)资助.
  • 相关项目:非等效应非单调浓度-响应关系混合物通用浓度加和模型
中文摘要:

验证定量-结构活性相关(QSAR)模型,是保证模型对未知样本的生物活性具有可靠预测能力的重要前提.然而,目前部分QSAR论文没有对模型进行有效验证.因此,本文详细综述QSAR模型的内部验证方法和外部验证方法.内部验证方法包括留一法(leave-one-out,LOO)交叉验证,留多法(leave-many-out,LMO)或留N法(leave-N-out,LNO)交叉验证,y随机化验证和自举法.评价模型外部预测能力的统计量包括Q2F1、Q2F2、Q2F3、一致性相关系数(concordance correlation coefficient,CCC)、r珋2m和Golbraikh-Tropsha方法.此外,从文献中总结出可接受QSAR模型对应的统计量参考数值,从而为QSAR建模者提供指导与帮助.

英文摘要:

Validation of a quantitative structure-activity relationship (QSAR) model plays an important role lor ensuring the reliable predictive ability of activity of untested chemicals. Currently, a number of QSAR models, however, lack reliable validation. The present study reviews the internal validation and external validation methods that exist for QSAR model. The internal validations include leave-one-out (LO0) cross-validation, leave-many-out (LMO) or leave-N-out (LNO) cross-validation, y-randomization test and bootstrapping, while the external validations include the statistical parameters Q^2F1 , Q^2F2 , Q^2F3 , concordance correlation coefficient (CCC)r^-2m , and Golbraikh-Tropsha method. Furthermore, the cutoff values of the different statistical parameters for an acceptable model were recommended according to the references. The internal and external validations addressed in this study together with the recommended cutoff values of statistical parameters may help researchers to develop QSAR models.

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期刊信息
  • 《环境化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院生态环境研究中心
  • 主编:郭良宏
  • 地址:北京2871信箱
  • 邮编:100085
  • 邮箱:hjhx@rcees.ac.cn
  • 电话:010-62923569
  • 国际标准刊号:ISSN:0254-6108
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1844/X
  • 邮发代号:82-394
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:27127