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茶树实时荧光定量PCR分析中内参基因的选择
  • 期刊名称:植物学报
  • 时间:0
  • 页码:579--587
  • 语言:中文
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]安徽农业大学农业部茶叶生物化学与生物技术重点实验室,合肥230036, [2]安徽农业大学生命科学学院,合肥230036
  • 相关基金:973计划前期项目(No.2007CB116211); 国家自然科学基金(No.30771755和No.30972401); 安徽省自然科学基金(No.09041-1006)
  • 相关项目:茶儿茶素生物合成途径与调控研究
中文摘要:

选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR分析(qRT-PCR)准确性的先决条件。该文以茶树(Camellia sinensis)芽、叶、幼根、嫩茎、花瓣、种子和愈伤组织为材料,应用实时荧光定量PCR技术,分析了18S rRNA、GAPDH、β-actin和α-tubulin4个常用内参基因在茶树不同器官组织中的表达情况。经GeNorm和NormFinder软件分析发现,当利用荧光定量PCR分析比较茶树不同器官组织中的基因表达差异时,可选择β-actin作为校正内参基因;而比较不同成熟度的叶片和愈伤组织时,可以选择GAPDH作为校正内参基因。

英文摘要:

The selection of a suitable reference gene is an important prerequisite for successful gene expression analysis by real-time fluorescence quantitative PCR (qPCR).We investigated the expression stability of 4 endogenous candidate genes (18S rRNA,GAPDH,β-actin and α-tubulin) in qPCR experiments in different organs and tissues,including buds,leaves,young roots,stem,petals,seeds,and callus,of the tea plant Camellia sinensis (L.) O.Kuntze.The analysis with GeNorm and NormFinder algorithms revealed that β-actin could be used as a reference gene for organs and tissues and GAPDH for mature leaves and callus.

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