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交叉酶切联合MALDI—TOF/MS分析重组蛋白二硫键分布的方法建立
  • ISSN号:0529-6579
  • 期刊名称:《中山大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q3[生物学—遗传学] Q71[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中山大学中山医学院生化教研室,广东广州510080, [2]中山医学院蛋白质组学实验室,广东广州510080
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30700120,30973449,81070746);“新药创制”科技重大专项基金资助项目(2009ZX09103-642);中央高校基本科研业务费专项资金资助项目(3161001);广东省自然科学基金资助项目(10151008901000007)
中文摘要:

以Kringle环为分子模型,应用MALDI—TOF/MS联合特异性蛋白酶酶切技术,探讨建立蛋白质二硫键分布和定位分析的研究方法。采用pET22b(+)原核表达体系诱导表达重组人纤溶酶原K5蛋白(rhK5),经Ni^2+-NTAresin亲和层析纯化,并通过SDS—PAGE和Western-blot进行初步鉴定;采用MTY法分析rhK5对微血管内皮细胞的抑制活性;联合应用交叉酶切(TrypsinGold单切或Trypsin Gold及Endoproteinase ASP—N双酶切)和基质辅助激光解析一飞行时间质谱(MALDI—TOF/MS)分析rhK5的二硫键分布;并应用生物信息学方法和圆二色谱法进一步验证rhK5二级结构。应用原核体系高效表达具有生物活性的rhK5蛋白,经交叉酶切联合MAL—DI—TOF/MS证实rhI(5中的6个半胱氨酸正确配对形成了3对二硫键(Cys462:541,Cys483:524和CysS12:536),圆二色谱法测定发现rhK5为典型的B折叠型结构。上述研究结果为分析基因工程重组蛋白质中半胱氨酸配对及二硫键分布提供了方法学基础。

英文摘要:

In order to establish a method for analyzing the distribution and localization of disulfide in recombinant protein by specific protease digestion combined with MALDI-TOF/MS. The pET22b ( + ) prokaryotic system was harnessed to generate recombinant protein of human plasminogen kingle (rhK5) which was purified by Ni2+ -NTA resin affinity chromatography. SDS -PAGE and Western blot analysis were used to identify the recombinant protein. The disulfide bridging conformation and dimensional structure of rhK5 were predicted by 3D-JIGSAW Comparative Modeling Server (UK) and the disulfide bond distribution of rhK5 was confirmed by orthogonal enzymatic digestion and MALDI-TOF/MS. The seeondary structure of rhK5 was analyzed by circular dichroism. Enzymatic digestion and MALDI-TOF/MS analysis demonstrated the presence of disulfide bridges among Cys462-Cys541, Cys483-Cys524 and Cys512- Cys536 in rhKS. Circular dichroism showed that rhK5 adopted the shape characteristic of a β - sheet. Our studies provide methodological basis for analyzing the pairing and distribution of disulfide bond of genetic engineering recombinant proteins

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期刊信息
  • 《中山大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:国家教育部
  • 主办单位:中山大学
  • 主编:王建华
  • 地址:广州市新港西路135号
  • 邮编:510275
  • 邮箱:xuebaozr@mail.sysn.edu.cn
  • 电话:020-84111990
  • 国际标准刊号:ISSN:0529-6579
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1241/N
  • 邮发代号:46-15
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高等学校自然科学学报及教育部优秀科技期...,广东省优秀科学技术期刊一等奖,《中文核心期刊要目总览》综合性科技类核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18509