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DNA序列碱基组合的频率矩阵及其应用
  • ISSN号:1000-5013
  • 期刊名称:华侨大学学报(自然科学版)
  • 时间:2013.5.20
  • 页码:308-312
  • 分类:Q332[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]燕山大学理学院,河北秦皇岛066004, [2]石家庄邮电职业技术学院计算机系,河北石家庄050021
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(11201409)
  • 相关项目:图与单纯复形的EKR型交性质研究
中文摘要:

基于碱基组合在DNA序列中出现的频率,构造11个物种的p-globin基因第一个外显子的编码序列的频率矩阵.借助矩阵2-范数对11个物种进行相似性比较,并结合柱状图对物种之间的相似性进行分析.研究结果表明:所构造的DNA序列频率矩阵不仅能够反映出DNA序列中碱基及碱基组合的含量分布,而且能够显示出序列碱基突变的情况.

英文摘要:

The frequency matrix of coding sequence of the first exon of β-globin gene of eleven species was proposed based on the frequencies of nucleotide combinations in the DNA sequences. The similarity of eleven species was compared with the aid of 2-norm of matrix. Moreover, the similarity analysis was spread among species with column graphs. The results showed that the frequency matrix of DNA sequences not only could reflect the content distribution of nucleotides and nucleotide combinations in DNA sequences, but also could display the mutations of sequences nucleotides.

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期刊信息
  • 《华侨大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:福建省教育厅
  • 主办单位:华侨大学
  • 主编:
  • 地址:中国福建泉州华侨大学校内杨思椿科学馆五楼
  • 邮编:362021
  • 邮箱:journal@hqu.edu.cn
  • 电话:0595-22692545
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5013
  • 国内统一刊号:ISSN:35-1079/N
  • 邮发代号:34-41
  • 获奖情况:
  • 1995年11月,获教育部科技司颁发的“全国优秀高校...,1997年3月,获中宣部、国家教委、新闻出版署颁发...,1999年7月,获教育部颁发的“全国优秀高校自然科...,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5573