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十字花科黑腐病菌RNA提取与质量鉴定
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q782[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]广西大学生命科学与技术学院, [2]广西亚热带生物资源保护利用重点实验室,广西南宁530005
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30470020);广西自然科学基金项目(桂科青0728002).致谢 感谢北京博奥生物芯片有限责任公司暨生物芯片北京国家工程研究中心提供的技术帮助.
中文摘要:

十字花科黑腐病菌,学名野油菜黄单胞菌野油菜致病变种(Xanthomonas campestris pv.campestris,简称Xcc),是一类γ-变形菌纲的革兰氏阴性细菌,能在世界范围内侵染十字花科植物,给农业生产造成重大损失。RNA是分子生物学的主要研究对象之一,提取高质量的RNA是研究十字花科黑腐病菌基因表达调控机理的基础。由于Xcc能产生大量胞外多糖及黄单胞色素,且细菌RNA半衰期较短,目前尚缺少一种大量提取Xcc高质量RNA的有效方法。该研究在参考多种RNA提取方法的基础上,建立了一种简单、有效的适合十字花科黑腐病菌RNA的提取方法。得到的RNA样品经过紫外分光光度法和甲醛变性凝胶电泳检测,证实为完整、均一的总RNA,达到了表达谱分析及cDNA文库构建的要求。

英文摘要:

Xanthomonas campestris pathovar campestris (Xcc) is a yellow pigmented gramnegative bacterium that belongs to the γ-subdivision of proteobacteria. This bacterium can infect cruciferous plants world-wide, causing severe losses in agricultural production. RNA is an important genetic material, thus the isolation and purification of RNA samples is a key step for elucidating the mechanisms of gene expression and regulation in Xcc. However, Xcc can produce more exopolysaccharides and xanthomonadin than many other bacteria; the isolation of high quality RNA from this bacterium is difficult. There is no an efficient method for isolating high quality RNA from Xcc. In this study, a simple and effective method for extracting total RNA from Xcc was established. The isolated RNA sample was determined in integrity and purity by using formaldehyde agarose gel electrophoresis and UV spectrophotometer and was found to be suitable for constructing cDNA library and screening differential expressed genes by RT-PCR or microarray analysis.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299