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差异荧光凝胶电泳法分析不同转移潜能人肝癌细胞系的蛋白质组
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]复旦大学化学系,上海200032, [2]复旦大学上海医学院生物医学研究院,上海200032
  • 相关基金:本文系国家重点基础研究计划(Nos.2013CB910502,2012CB910602)、国家科技重大专项(No.2012ZX10002-012),国家自然科学基金(Nos.30700990,20975024)资助
中文摘要:

本研究应用差异凝胶电泳(Difference gel electrophoresis,DIGE)和质谱鉴定技术,系统分析了4种具有不同转移潜能的人肝癌细胞系的蛋白质表达差异.胶上鉴定了约1700个蛋白质斑点,经过比对后发现167个蛋白质点存在差异,经过质谱分析成功鉴定了146个蛋白质点,对应96个与肝癌转移相关的非冗余差异蛋白.对差异蛋白进行生物信息学分析,结果表明细胞组装和运动相关的蛋白在转移过程中被富集.差异蛋白前列腺脱氢酶(Hydroxyprostaglandin dehydrogenase,HPGD)首次被证明与肝癌转移正相关,具有抗凋亡和促侵袭的能力.

英文摘要:

Differential proteomics with difference gel electrophoresis (DIGE) and mass spectrometry (MS) was carried out on the four hepatocellular carcinoma (HCC) cell lines with different metastasis potential to identify HCC metastasis related proteins. Total of 1700 protein spots were found in the gel, 167 of which had quantitative differences between cell lines. Through MS identification, total of 146 differentially expressed protein spots, corresponding to 96 non-redundant proteins were found out. Bioinformatic analysis showed that most metastasis related proteins was involved in cell assembly and movement. Hydroxy-prostaglandin dehydrogenase (HPGD) was found to be positively related to HCC metastasis through inhibiting apoptosis and promoting invasion.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455