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三角帆蚌短型肽聚糖识别蛋白S3基因克隆及表达分析
  • ISSN号:1000-3207
  • 期刊名称:《水生生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q344.1[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]江西师范大学生命科学学院,南昌330022, [2]江西农业大学动物科学学院,南昌330045
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31060359);江西省自然科学基金(20122BAB204017)资助
中文摘要:

肽聚糖识别蛋白(PGRPs)是机体先天免疫系统中的重要模式识别受体,研究对三角帆蚌的一种短型肽聚糖识别蛋白进行了克隆与表达分析。研究采用5’、3’ RACE技术,对高通量转录组测序所得三角帆蚌PGRPS3基因(hcPGRPS3)片段分别进行了5’,3’末端克隆,经拼接得到hcPGRPS3 cDNA全长序列。采用多种分子生物学软件对hcPGRPS3 cDNA全长序列进行了特征分析,实时荧光定量(qRT-PCR)检测了其组织分布,及经肽聚糖(Peptidoglycan,PGN)和脂多糖(Lipopolysaccharide,LPS)刺激后其在肝胰腺中的基因表达变化。hcPGRPS3 cDNA全长1438 bp,开放阅读框为858 bp,编码285个氨基酸,预测分子量大小为32.3 ku,pH 7.0时的理论等点为7.98。序列中不存在信号肽与跨膜结构。氨基酸序列保守性分析表明,其他物种短型PGRP中,以夏威夷短尾鱿PGRP4与hcPGRPS3同源性最高(51%)。qRT-PCR检测结果显示,hcPGRPS3在性腺及肝胰腺中表达水平较高。经PGN或LPS刺激后,肝胰腺中hcPGRPS3表达水平显著上调,表明hcPGRPS3可能在机体抗菌免疫反应中发挥重要作用。

英文摘要:

The present study cloned and sequenced Hyriopsis cumingii PGRPS3 (hcPGRPS3) and measured its expree- sion in multiple tissues. Results showed that the hcPGRPS3 cDNA sequence was 1438 bp in length, consisting of a 858 bp open reading frame ( ORF) encoding 285 amino acid residues with 32.3 ku of predicted molecular weight and 7.98 of the theoretical isoelectric point, which have no signal petptide and transmembrane helices but have two latent N-glycosylation sites N40PT and N92YS. Multiple alignment analysis revealed that hcPGRPS3 shareed the highest identity with Euprymna scolopes PGRP4 (51%). hcPGRPS3 expressed in all examined organs of healthy H. cumingii with the low level in gill, heart and mantle and high level in gonad and hepatopancreas. Lipopolysaccharide and Pepti-doglycan obviously up-regulated the expression of hcPGRPS3 in hepatopancreas, suggesting that hcPGRPS3 may play an important role in H. cumingii hepatopancreas innate immunity system against bacterial challenged.

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期刊信息
  • 《水生生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中科院水生所
  • 主编:桂建芳
  • 地址:武昌东湖南路7号中科院水生所
  • 邮编:430072
  • 邮箱:Acta@ihb.ac.cn
  • 电话:027-68780701
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3207
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1230/Q
  • 邮发代号:82-329
  • 获奖情况:
  • 湖北省十佳重点期刊,中国农学会中国水产学会优秀科技期刊一等奖,中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21674