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三角帆蚌热休克蛋白60基因克隆及其表达分析
  • ISSN号:1000-3207
  • 期刊名称:《水生生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q781[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:江西师范大学生命科学学院, 南昌大学生命科学与食品工程学院
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31060359);江西省自然科学基金(20122BAB204017)资助
中文摘要:

利用3′RACE技术,对高通量转录组测序所得三角帆蚌HSP60基因(hcHSP60)长片段(2629 bp)进行了3?末端克隆,经拼接得到hcHSP60 cDNA全长序列。采用多种分子生物学软件对hcHSP60 cDNA全长序列进行了特征分析,并采用RT-PCR技术检测了其组织分布及经冷热应激后的表达变化。结果显示,hcHSP60cDNA全长为2807 bp,其中开放阅读框为1707 bp,编码568个氨基酸,预测分子量大小为61.04 ku,pH 7.0时的理论等电点为5.63。序列中不存在信号肽与跨膜结构。氨基酸序列保守性分析表明,hcHSP60氨基酸序列与光滑双脐螺HSP60同源性最高(达82%),而与牙鲆、白云金丝鱼HSP60的同源性最低(为75%)。RT-PCR检测结果表明,hcHSP60在肝胰腺中的表达水平最高,而在血液中的表达水平最低。30℃与35℃水温处理三角帆蚌4h后,各组织中hcHSP60表达水平明显上升,表明hcHSP60可能在三角帆蚌耐热应激反应中起着重要作用。

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期刊信息
  • 《水生生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中科院水生所
  • 主编:桂建芳
  • 地址:武昌东湖南路7号中科院水生所
  • 邮编:430072
  • 邮箱:Acta@ihb.ac.cn
  • 电话:027-68780701
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-3207
  • 国内统一刊号:ISSN:42-1230/Q
  • 邮发代号:82-329
  • 获奖情况:
  • 湖北省十佳重点期刊,中国农学会中国水产学会优秀科技期刊一等奖,中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21674