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巴西橡胶树HbERFB4-1基因的克隆和表达分析
  • ISSN号:1005-3395
  • 期刊名称:热带亚热带植物学报
  • 时间:2012
  • 页码:135-140
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]海南大学农学院,海口570228, [2]中国热带农业科学院热带生物技术研究所,农业部热带作物生物技术重点开放实验室,海口571101, [3]海南省农业科学院,海口571000
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31000313); 海南省自然科学基金项目(309052); 中央级公益性科研院所业务费专项资金资助项目(ITBB110201)资助
  • 相关项目:Ca2+/HbCDPK1调节蔗糖代谢参与乙烯利刺激橡胶树增产的机制
中文摘要:

根据EST序列信息,利用RACE技术分离了巴西橡胶树(Hevea brasiliensis)的1个AP2/ERF类基因,命名为HbERFB4-1。该基因cDNA全长732 bp,含有完整的开放阅读框架,编码147个氨基酸,不含内含子。推导的HbERFB4-1氨基酸序列与杨树(Populus trichocarpa)、蓖麻(Ricinus communis)、拟南芥(Arabidopsis thaliana)和大豆(Glycine max)中相应蛋白氨基酸序列的一致性分别为78%、71%、62%和55%,具有典型的AP2类蛋白结构特征。聚类分析表明,HbERFB4-1属于ERF家族B4亚族。半定量RT-PCR分析结果表明,该基因在胶乳中的表达量相对较低,但乙烯利刺激后其在胶乳中的表达量迅速增加,推测该基因可能参与了胶乳中乙烯信号的转导。

英文摘要:

Based on EST sequences from an ethephon-induced latex SSH cDNA library of Hevea brasiliensis,a full-length cDNA encoding AP2/ERF type gene named as HbERFB4-1,was cloned from H.brasiliensis by RACE-PCR.The HbERFB4-1 cDNA has full length of 732 bp with an open reading frame(ORF) of 444 bp,and encodes 147 amino acid residues.No introns were detected in HbERFB4-1gene.The deduced HbERFB4-1 contains an AP2 domain and three NISs,which shows high identity to AP2/ERF in Populus trichocarpa,Ricinus communis,Arabidopsis thaliana and Glycine max,counting for 78%、71%、62% and 55%,respectively.Phyogenetic analysis showed that HbERFB4-1 belonged to the B4 subfamily of ERF family.Semi-quantitative RT-PCR analysis indicated that the transcription of HbERFB4-1 in latex was low,but it was rapidly induced by ethephon,suggesting that HbERFB4-1 is involved in the ethylene signal pathway in latex of H.brasiliensis.

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期刊信息
  • 《热带亚热带植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院华南植物园 广东省植物学会
  • 主编:黄宏文
  • 地址:广州市天河区兴科路723号中国科学院华南植物园行政办公楼2楼
  • 邮编:510650
  • 邮箱:jtsb@scib.ac.cn
  • 电话:020-37252514
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-3395
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1374/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊,广东省优秀科技期刊,执行《CD-CAJ》规范奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11360