位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
SELEX筛选LPS寡核苷酸适配子方法的建立
  • ISSN号:1671-8348
  • 期刊名称:重庆医学
  • 时间:0
  • 页码:1773-1775
  • 语言:中文
  • 分类:Q785[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]第三军医大学大坪医院野战外科研究所神经内科,重庆400042
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金资助项目(NSFC:30500640).
  • 相关项目:新型LPS拮抗剂的筛选及其对实验性内毒素血症的影响
中文摘要:

目的建立SELEX筛选LPS的适配子方法,为后续大规模筛选奠定基础。方法在成功构建含40个随机序列的单链DNA(ssDNA)文库的基础上,优化了扩增为双链DNA(dsDNA)文库的PCR反应争件;同时对液相筛选与固液相筛选两种方法进行比较,确定最优的筛选方法并进行4轮筛选。结果确定了扩增为双链DNA(dsDNA)文库的PCR反应的最佳条件,采用液相筛选方法经过4轮筛选,随机单链DNA(ssDNA)文库与内毒素(LPS)的结合率明显上升,CPM值与初始库相比差异有统计学意义。结论建立了SELEX筛选LPS寡核苷酸适配子的筛选方法。

英文摘要:

Objective To construct the method for systematic evolution of ligands by exponential enrichment(SELEX) screening aptamers of LPS from ssDNA random library and to provide the foundation for large scale screening. Methods A 84 nucleotides ssDNA pool containing 40 random nucleotides flanked by invariant primer was designed. The PCR reaction conditions were optimized for converting the ssDNA pool into dsDNA pool. Compared to liquid phase screening and solid phase screening, the optmizing method was determined and 4 rounds selections were done, Results The optmizing PCR amplification for screening condition for converting the ssDNA pool into dsDNA pool was determined, After 4 rounds selections by liquid phase method, the combination percentage of the ssDNA pool bound to LPS inceased. CPM value had signifcant difference compared with initiate pool, Conclusion A procedure for SELEX screening aptamers of LPS from ssDNA random library is constructed.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《重庆医学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:重庆市卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:重庆市卫生信息中心
  • 主编:吴开明
  • 地址:重庆市渝北区回兴唐家沟宝环路420号
  • 邮编:401120
  • 邮箱:
  • 电话:023-61965157
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-8348
  • 国内统一刊号:ISSN:50-1097/R
  • 邮发代号:78-27
  • 获奖情况:
  • “中国科技论文在线”2011年“一等奖”,2012年重庆市新闻出版局“重庆报刊发展专项基金”
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:91150