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Septin4_I2基因活化肝星状细胞中的表达及序列生物信息学分析
  • ISSN号:1673-5234
  • 期刊名称:中国病原生物学杂志
  • 时间:2013.5.30
  • 页码:399-403
  • 分类:R392[医药卫生—免疫学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]中国人民解放军61398祁队门诊部,上海200137, [2]南通大学医学院病原生物学系,江苏南通226001
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.81171589); 江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD); 南通大学自然科学基金项目(No.11Z002)
  • 相关项目:Septin4对日本血吸虫肝纤维化中肝星状细胞的作用及机制的研究
中文摘要:

目的观察活化的肝星状细胞中Septin4_I2基因的表达,并对其进行生物信息学分析。方法采用实时荧光定量PCR法观察活化的肝星状细胞LX-2中Septin4_I2基因的表达,利用网络平台和生物软件分析Septin4_I2序列。结果活化的肝星状细胞中Septin4_I2基因表达上调。Septin4_I2基因序列含有5个内含子及保守的GTP结合位点。Septin4_I2蛋白以loop结构为主,氨基酸序列中含有数个丝氨酸、苏氨酸及酪氨酸磷酸化位点,含有特异性的蛋白激酶K、蛋白激酶C及酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点,含有N-豆蔻酰化位点。结论活化的肝星状细胞Septin4_I2基因表达上调,编码蛋白可能与细胞分裂相关。

英文摘要:

Objectives To observe Septin4_I2 expression in activated hepatic stellate cells (HSCs) and to sequence Septin4_I2. Methods Septin4_I2 expression in activated HSCs was analyzed with quantitative real-time PCR. The sequence of Septin4_I2 was analyzed with bioinformatics using web-based tools and several programs. Results Septin4_I2 expression was up-regulated in activated HSCs. The Septin4_I2 sequence had five introns and GTP-binding sites were also present in Septin4_I2. The Septin4_I2 protein consists primarily of a loop structure. It is predicted to contain serine phosphorylation sites, threonine phosphorylation sites, tyrosine phosphorylation sites, protein kinase C and protein kinase A phosphorylation sites, casein kinase Ⅱ phosphorylation sites, and N-myristoylation sites. Conclusion The expression of Septin4_I2 is up-regulated in activated HSCs. Septin4_I2 may play an important role in the process of cell division.

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期刊信息
  • 《中国病原生物学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:中华预防医学会 卫生部疾病控制司 山东省寄生虫病防治研究所
  • 主编:庄辉
  • 地址:山东省济宁市太白楼中路11号
  • 邮编:272033
  • 邮箱:www.cjpb.org
  • 电话:0537-2342934
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-5234
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5457/R
  • 邮发代号:24-81
  • 获奖情况:
  • 中华预防医学会、系列杂志优秀期刊,山东省优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 英国农业与生物科学研究中心文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:8395