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深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652遗传操作系统的建立
  • ISSN号:1001-8689
  • 期刊名称:中国抗生素杂志
  • 时间:2012
  • 页码:105-111
  • 分类:Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院海洋生物资源可持续利用重点实验室,广东省海洋药物重点实验室,中国科学院海洋微生物中心,中国科学院南海海洋研究所,广州510301, [2]中国科学院研究生院,北京100049, [3]德州学院生物系,德州253023, [4]云南省微生物研究所,昆明650091
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(81072555);国家自然科学青年基金项目(31000051);中国科学院知识创新工程重要方向项目(KZCX2-YW-JC202,KSCX2-YW-G-065,KZCX2-EW-G-12);中国科学院南海海洋所领域前沿项目(LYQY200805)
  • 相关项目:抗生素A201A的生物合成机制及其工程改造
中文摘要:

目的建立深海放线菌Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652菌株的遗传操作系统,通过基因阻断研究次级代谢产物的生物合成途径。方法在对该菌株的全基因组进行测序的基础上,以基因组序列中编码非核糖体肽合成酶(Non-ribosomal peptide synthetase, NRPSs)的基因s102-A和s63-A为目标基因,利用PCR-targeting介导的基因置换技术构建了重组质粒,在加有3%海盐的培养基上,通过ET12567/puz8002属间接合转移导入SCSIO00652野生菌。结果接合子通过一代、二代松弛培养都无法得到双交换突变菌株,松弛培养四代后经抗性筛选,双交换率明显提高,PCR分析结果显示s102一A基因和s63一A基因均被成功阻断,HPLC分析结果显示突变株的发酵产物与野生型菌株有一定的差异。结论成功建立了深海放线菌Mthermotolerans SCSIO 00652的遗传操作系统,为对其它基因进行遗传学操作奠定了基础。

英文摘要:

Objective To develop a genetic system of the strain, Marinactinospora thermotolerans SCSIO 00652 and study its biosynthetic pathway of secondary metabolites using gene disruption. Method Two gene disruption cosmids targeting the adenylation domains of the s102-A and s63-A genes was constructed using PCRtargeting method. Intergeneric conjugation was followed for the transformation of ET12567/pUZ8002, into M. thermotolerans SCSIO 00652, when grown on modified ISP4 strains showing ApramycinRKanamycins were selected after medium. Results The double crossover recombinant culturing the single-crossover exconjugants for four generations without adding antibiotics and further verified by Polymerase Chain Reaction (PCR). Mutant strain showed difference in the fermentation product when compared to the wild type, which was further, evaluated using High Performance Liquid Chromatography (HPLC). Conclusion A genetic system of the deep sea marine bacterium M. thermotolerans SCSIO 00652 was successfully developed, setting the stage for future genetic manipulation of this strain to study functional genes to increase the potency of the bioactive metabolites at large scale.

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期刊信息
  • 《中国抗生素杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国医药集团总公司
  • 主办单位:中国医药集团总公司四川抗菌素工业研究所 中国医学科学院医药生物技术研究所
  • 主编:刘昌孝
  • 地址:四川成都市成华区龙潭都市工业集中发展区华冠璐168
  • 邮编:610052
  • 邮箱:cjap@163.com
  • 电话:028-84618674
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-8689
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1126/R
  • 邮发代号:62-193
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国国际药学文摘,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,荷兰医学文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:17918