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利用磺基异硫氰酸苯酯化学辅助方法鉴定磷酸化肽修饰位点
  • ISSN号:1007-7626
  • 期刊名称:《中国生物化学与分子生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q5[生物学—生物化学] Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]湖南师范大学生命科学学院,长沙410081, [2]中南大学湘雅医学院,长沙410078
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目No:39990600.
中文摘要:

利用MALDI-TOF质谱结合磺基异硫氰酸苯酯(SPTTC)化学辅助的从头测序(de novo sequencing)方法,将用固相金属离子亲和色谱(immobilized metal affinity chromatography,IMAC)选择性地从混合物中亲和提取的磷酸肽进行磷酸化位点测定,该方法只有肽键断裂产生的带C端的碎片离子系列(y^+离子系列)出现在质谱图中,图谱背景清晰,信噪比高,单纯的y^+片段离子系列使得谱图解析变得非常容易,对于多磷酸化肽的磷酸化位点,不需借助于任何软件,只需简单地计算两峰之间的分子量之差即可确定。

英文摘要:

Phosphorylated peptides have been detected and phosphorylation modified sites have been identified very sensitively by combining immobilized metal affinity chromatography (IMAC) affinity capture with chemically assisted de novo sequencing followed 4-sulfophenyl isothiocyanate (SPITC) derivatization by MALDI-TOF mass spectrometry. The N-terminal sulfonation of phosphopeptide by SPITC enhanced MALDI- TOF-PSD fragmentation signals and produced a spectrum containing only y^+ ions. This method facilitated de novo sequencing and spectrum interpretation. The characterization of phosphorylated sites can simply calculated from mass differences between the adjacent y-ion, and advanced software is not need.

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期刊信息
  • 《中国生物化学与分子生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国生物化学与分子生物学会 北京大学
  • 主编:周春燕
  • 地址:北京市学院路38号北京大学医学部
  • 邮编:100083
  • 邮箱:shxb@bjmu.edu.cn
  • 电话:010-82801416
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7626
  • 国内统一刊号:ISSN:11-3870/Q
  • 邮发代号:82-312
  • 获奖情况:
  • 被美国《CA》列入世界引用频次最高的《千种表》
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:9731