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甘蔗细胞质型苹果酸脱氢酶基因的克隆及其表达分析
  • ISSN号:1005-3395
  • 期刊名称:《热带亚热带植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q959.468[生物学—动物学]
  • 作者机构:[1]福建农林大学,农业部甘蔗遗传改良重点开放实验室,甘蔗综合研究所,福州350002, [2]福建农林大学生命科学学院,福州350002, [3]福建农林大学水稻遗传研究所,福州350002
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30700514);农业部2010年引进国际先进农业科学技术“948”计划项目(2010-C21)资助
中文摘要:

对甘蔗(Saccharumofficinarum L.)叶片全长cDNA文库进行测序,获得了1个细胞质型苹果酸脱氢酶(cMDH)基因的全长cDNA序列,命名为Sc—cMDH。生物信息学分析表明,该基因全长1314bp,开放阅读框为999bp,编码332个氨基酸。Sc—cMDH与其他植物cMDH的氨基酸序列同源性高达86.5%~97.0%。Sc.cMDH包含典型的NAD结合基元T“GAAGQI”和催化基元1184WGNH’船,还有相当保守的6个半胱氨酸残基,因此推断该基因为细胞质型NAD—MDH。定量PCR分析结果表明,该基因在甘蔗叶片和根中的表达量高于茎。

英文摘要:

A full-length cDNA sequence of sugarcane (Saccharum officinarum L.) cytosolic malate dehydrogenase (cMDH) gene, named as Sc-cMDH, was obtained from sugarcane full-length cDNA library by EST sequencing and bioinformatics analysis. The full-length of Sc-cMDH was 1314 bp with 999 bp open reading frame, encoding 332 amino acids. Sc-cMDH shared 86.5%-97.0% of amino acids with cMDH from other 9 species. Sc-cMDH contains typical NAD+ binding motif (THGAAGQ117) and catalytic motif (II84WGNH188). Real-time PCR analysis showed that the expression of Sc-cMDH was higher in leaves and roots than that in stems of sugarcane.

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期刊信息
  • 《热带亚热带植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院华南植物园 广东省植物学会
  • 主编:黄宏文
  • 地址:广州市天河区兴科路723号中国科学院华南植物园行政办公楼2楼
  • 邮编:510650
  • 邮箱:jtsb@scib.ac.cn
  • 电话:020-37252514
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-3395
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1374/Q
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊,广东省优秀科技期刊,执行《CD-CAJ》规范奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:11360