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基于基因表达子宫内膜癌的分类
  • ISSN号:1000-0984
  • 期刊名称:《数学的实践与认识》
  • 时间:0
  • 分类:TP391.4[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:中北大学理学院,山西太原030051
  • 相关基金:国家自然科学基金(61275120)
中文摘要:

建立了四类基于基因表达的分类器,用以将87名妇女的子宫内膜样本分成癌症患者和非癌症患者.首先利用信噪比过滤掉无关基因,然后利用主成分分析降低样本维数,再针对这四类分类器随机取75个样本作为训练样本,其余的12个样本作为测试样本,实验结果表明这四类分类器适合子宫内膜癌的分类.最后采用留一交叉验证作为评判标准,通过比较,说明5BP-ELMAN分类器是一类更适合子宫内膜癌分类的有效的肿瘤分类器.

英文摘要:

In the paper, four kinds of classifiers based on gene expression are built to classify 87 women' endometrial samples into one class with the endometrial cancer and the other class with cancer-free. Firstly, use SNRs to filter irrelevant genes and then principal component analysis method to decrease the dimensions. Randomly take 75 samples as trained samples and other 12 samples as tested samples for these classifiers. The results are these four classifiers are suitable for classification of endometrial cancer. Finally use leave-one-out cross validation as evaluation criteria. By comparison, the results are shown that 5BP-ELMAN classifier is an effective tumor classifier more suitably for classification of the endometrial cancer.

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期刊信息
  • 《数学的实践与认识》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院数学与系统科学研究院
  • 主编:林群
  • 地址:北京大学数学科学学院
  • 邮编:100871
  • 邮箱:bjmath@math.pku.edu.cn
  • 电话:010-62759981
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0984
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2018/O1
  • 邮发代号:2-809
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国数学评论(网络版),德国数学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:22973