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基于全菌消减SELEX技术的体外筛选大肠埃希菌O157:H7适配体研究
  • ISSN号:1001-5914
  • 期刊名称:《环境与健康杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R117[医药卫生—公共卫生与预防医学]
  • 作者机构:[1]南昌大学公共卫生学院,江西南昌300006, [2]军事医学科学院卫生学环境医学研究所天津市环境与食品安全风险监控技术重点实验室
  • 相关基金:国家自然科学基金(81270041)
中文摘要:

目的筛选出能特异性识别大肠埃希菌O157:H7的单链DNA(ss DNA)适配体并进行鉴定。方法利用全菌消减SELEX技术,以完整菌体为靶标菌和消减菌,通过体外筛选方法筛选出大肠埃希菌O157:H7特异性ss DNA适配体。利用荧光分光光度计、激光共聚焦显微镜、克隆测序、Chromas和DNAMAN分析软件,分析适配体的一、二级结构,并对筛选得到的适配体进行特异性鉴定。结果经过7轮全菌消减SELEX筛选,荧光分光光度计检测结果鉴定第六轮文库富集达到饱和;通过测序分析、荧光分光光度计和激光共聚焦显微镜特异性检测,获得1条与大肠埃希菌O157:H7特异性结合的适配体Aptamer1。结论利用全菌消减SELEX技术成功筛选获得大肠埃希菌O157:H7特异性ss DNA适配体。

英文摘要:

Objective To select and identify ss DNA aptamers which can specifically bind to the Escherichia coli O157:H7.Methods With whole bacteria as target and counter target, whole-bacterium based subtractive SELEX was used to screen the Escherichia coli O157:H7-specific ss DNA aptamer. The selection procedure and aptamer was identified by spectrophotofluorometer, confocal laser scanning microscope,gene cloning and sequencing; Chromas and DNAMAN software were employed to analyze the primary structure and predict the secondary structure of the aptamer. Results After seven selection rounds, the identification of spectrophotofluorometer showed the enrichment of ss DNA in the sixth round had reached saturation. The Escherichia coli O157:H7-specific aptamer named Aptamer 1 was eventually singled out after gene sequencing and specificity test by spectrophotofluorometer and confocal laser scanning microscope. Conclusion The Escherichia coli O157:H7-specific aptamer has been successfully obtained after seven round selection by whole-bacterium based subtractive SELEX.

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期刊信息
  • 《环境与健康杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:国家卫生和计划生育委员会
  • 主办单位:天津市疾病防控制中心 中华预防医学会
  • 主编:王撷秀
  • 地址:天津市河东区华越道6号
  • 邮编:300011
  • 邮箱:hjyjk@263.net
  • 电话:022-24333577
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-5914
  • 国内统一刊号:ISSN:12-1095/R
  • 邮发代号:6-221
  • 获奖情况:
  • 中华预防医学会系列杂志优秀期刊,天津市一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20716