我国传统的水功能区水质达标评价方法没有考虑水环境系统中的不确定性,可能导致评价结果出现突变,以至于难以进行有效地水质预警。为了克服这些问题,将集对分析理论引入水功能区管理,建立了水功能区水质达标指数模型,并以江苏省新通扬运河海安饮用水水源区为例进行了应用研究。结果表明,与传统方法相比,水功能区水质达标指数模型能够更好地衡量水环境系统中的不确定性,而且具有更好的预警效果与鲁棒性。