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鼻咽癌复发的分子标志物Jab1和Akt1蛋白表达的差异
  • ISSN号:1000-4718
  • 期刊名称:《中国病理生理杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R363.121[医药卫生—病理学;医药卫生—基础医学]
  • 作者机构:[1]中山大学中山医学院,广东广州510080, [2]中山大学中山医学院病理生理学教研室,广东广州510080, [3]南方医科大学基础医学院医学遗传学教研室,广东广州510515
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(No.81071837;No.81372410); 广东省自然科学基金重点项目(No.92510089;No.01000005); 国家大学生创新训练计划项目(No.201310558074;No.201210558076); 广东省大学生创新训练项目(No.1055813171)
中文摘要:

目的:比较同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞CNE2R/CNE2间总甲基化水平及其区域的差异。方法:采用赵存友博士改良的基于甲基化敏感酶全基因组甲基化法检测CNE2R/CNE2细胞全基因组甲基化水平;同时采用Me DIP-Seq测序法对CNE2R/CNE2细胞进行测序,分析比较DNA甲基化区域(主包括6个基因功能元件即CDS、intron、downstream2k、upstream2k、3’UTR及5’UTR)的差异。结果:CNE2R细胞全基因组甲基化水平比CNE2细胞低约30%;在CNE2R和CNE2细胞中,虽然分布在6个基因功能元件上的峰值个数和峰值在各基因元件上的覆盖度均无明显差异,但2种细胞的6个基因功能元件上基因甲基化存在差异。结论:同源不同辐射抗拒能力的鼻咽癌细胞间总甲基化水平及基因甲基化存在差异,推测DNA甲基化的差异可能与鼻咽癌辐射抗拒相关。

英文摘要:

AIM: To compare the differences of the genome-wide methylation levels and methylated regions between nasopharyngeal carcinoma( NPC) cells in the same genetic background but different radiation resistance( CNE-2cells and CNE-2R cells). METHODS: Using the method which was developed by Doctor Zhao Cun-you,based on using methyl-sensitive restriction enzyme to measure the genome-wide methylation levels. In addition,Me DIP-Seq was used to analyze the methylated regions in 6 gene functional elements,including the upstream 2k sequence,5 'UTR,coding sequence,intron,3'UTR and downstream 2k sequence,between CNE-2 cells and CNE-2R cells. RESULTS: The genomewide methylation level was approximately 30% lower in CNE-2R cells than that in CNE-2 cells. No obvious difference on the amount of genes and the coverage of the peak in the 6 gene functional elements was observed. However,the methylation pattern of plentiful genes had altered in the gene function elements. CONCLUSION: The genome-wide methylation levels and methylated regions between NPC cells in the same genetic background but different radiation resistance were quite different,indicating that the DNA methylation may be associated with NPC radioresistance.

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期刊信息
  • 《中国病理生理杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国病理生理学会
  • 主编:陆大祥
  • 地址:广东省广州市黄埔大道西601号
  • 邮编:510632
  • 邮箱:obsbjbb@jnu.edu.cn
  • 电话:020-85220269
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4718
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1187/R
  • 邮发代号:46-98
  • 获奖情况:
  • 1997-2000年连续获得中国科协优秀基础性和高科技...,1992、1996、2000、2004、2008年,连续五次入选中...,2008-2010年,连续三年荣获“百种中国杰出学术期...,2010年获广东省期刊最高奖——品牌期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:37010