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4种蛙皮肤活性肽的提取及生物活性比较
  • ISSN号:1005-4545
  • 期刊名称:中国兽医学报
  • 时间:0
  • 页码:357-371
  • 语言:中文
  • 分类:S859.7[农业科学—临床兽医学;农业科学—兽医学;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]吉林大学畜牧兽医学院,吉林长春130062, [2]天津农学院动物科学系,天津300384, [3]吉林大学植物科学学院,吉林长春130062
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30571416)
  • 相关项目:猪胸膜肺炎放线杆菌血清型特异的疫苗候选基因筛选
中文摘要:

为了解牛蛙皮肤抗菌肽的多样性及结构特点,根据GenBank数据库中蛙属抗菌肽基因信号肽序列设计简并引物,以RT-PCR技术扩增牛蛙皮肤抗菌肽基因,克隆得到cDNA全长序列并进行测序和序列分析。用生物信息学软件分析其cDNA序列特点,预测成熟肽的理化性质。结果得到48个完整的cDNA序列,分别编码24种抗菌肽前体,它们均由信号肽、前导肽和成熟肽3部分组成。对序列测定结果的预测分析表明,牛蛙皮肤抗菌肽前体核苷酸序列与已报道的其他蛙类抗菌肽具有较高的同源性,同源性达到80%以上,但成熟肽的序列变异很大,具有物种特异性,其中6个为新的抗菌肽序列。牛蛙皮肤抗菌肽成熟肽的二级结构主要以α-螺旋和β-折叠为主,均为疏水性短肽。

英文摘要:

To analyze the diversity and construction features of the skin antibacterial peptides of Rana catesbeiana,the degenerate primers were designed based on the signal peptide of Rana antibacterial peptides and subjected to RT-PCR amplification of corresponding cDNAs from Rana catesbeiana mRNA.cDNAs were cloned and sequenced.Properties of matured peptides were predicted by using informatics software tools.48 complete cDNAs were found to encode 19 antimicrobial peptides precursor including the signal peptide,prodomain peptide and mature peptide.The predicted results indicated that the precursor antibacterial peptides of Rana catesbeiana were high homology(more than 80 percent) with the other Rana antibacterial peptides reported previously,but hypervariable mature peptides possessed the species specificity.In which 6 show little amino acid sequence similarity to previously reported antimicrobial peptides,which could be a new family of Rana antibacterial peptide.The mature antibacterial peptides of Rana catesbeiana are all hydrophobic short peptides and the secondary structure is mainly α-helix and beta structure.All the above information will contribute to the further investigation of the physiology and biochemistry character,medical activity and the genetic expression of antibacterial peptides of Rana catesbeiana.

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期刊信息
  • 《中国兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学
  • 主编:王哲
  • 地址:吉林省长春市西安大路5333号
  • 邮编:130062
  • 邮箱:xbcjvs@163.com
  • 电话:0431-87836531 87836534
  • 国际标准刊号:ISSN:1005-4545
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1234/R
  • 邮发代号:12-105
  • 获奖情况:
  • 第二届全国优秀科技期刊评比二等奖,连续多次被评为全军优秀医学期刊一等奖,全国高校优秀自然科学学报评比一等奖,中国期刊方阵“双百”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:18973