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基于傅里叶变换红外光谱的大白菜根肿病定量测评
  • ISSN号:1000-0593
  • 期刊名称:光谱学与光谱分析
  • 时间:2015.5.15
  • 页码:1243-1247
  • 分类:O657.3[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]沈阳农业大学植物保护学院,辽宁沈阳100866, [2]中国农业科学院蔬菜花卉研究所,北京100081
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31201473); 中国农业科学院科技创新工程; 农业部园艺作物遗传改良重点开放实验室资助
  • 相关项目:基于红外光谱的黄瓜枯萎病快速检测基础研究
中文摘要:

大白菜根肿病是白菜生长中的"癌症",近年来在我国大面积发生,造成巨大经济损失。现有技术不能满足生产中对根肿病检测的需求,迫切需要一种快速、简便的大白菜根肿病定量化测评及检测技术。本研究利用傅里叶变换红外光谱(Fourier transform infrared spectrometer,FTIR)结合荧光定量PCR(Real-time PCR)技术,进行大白菜根肿病的定量测评技术研究。通过分析芸薹根肿菌、大白菜发病肿根和健康根的FTIR光谱,选择了1 105,1 145和1 228cm^-1三个根肿菌检测的特异性谱带,利用这三个谱带的峰面积值,建立了芸薹根肿菌的FTIR定量测评模型y=34.17+12.24x1-9.81x2-6.05x3,相关系数r=0.98(p〈0.05)。为了验证模型的有效性,田间随机选取10株大白菜根肿病样本,根据建立的大白菜根肿病FTIR光谱定量测评模型,计算大白菜根肿菌Ct值,结果显示平均预测误差为1.60%。说明试验构建的线性模型测定效果良好,可以根据大白菜根部样本的红外光谱,判断芸薹根肿菌的含量。本研究为十字花科蔬菜根肿病的定量、快速检测提供新的手段,为田间根肿菌的预测预防奠定基础。

英文摘要:

Clubroot,caused by Plasmodiophora brassicae,is considered the most devastating soilborne disease in Brassica crops.It has emerged as a serious disease threatening the cruciferous crop production industry in China.Nowadays,the detection techniques for P.brassicae are laborious,time-consuming and low sensitivity.Rapid and effective detection methods are needed.The objective of this study is to develop a Fourier transform infrared spectrometer(FTIR)technique for detection of P.brassicae effectively and accurately.FTIR and Real-time PCR techniques were applied in quantitative detection of P.brassicae.Chinese cabbages were inoculated with P.brassicae.By analyzing the FTIR spectra of P.brassicae,infected clubroots and healthy roots,three specific bands 1 105,1 145 and 1 228cm^-1 were selected.According to the correlation between the peak areas at these sensitive bands and Real-time PCR Ct value,quantitative evaluation model of P.brassicae was established based on FTIRy=34.17+12.24x1-9.81x2-6.05x3,r=0.98(p〈0.05).To validate accuracy of the model,10 clubroot samples were selected randomly from field,and detected by FTIR spectrum model,the results showed that the average error is 1.60%.This demonstrated that the FTIR technology is an available one for the quantitative detection of P.brassicaein clubroot,and it provides a new method for quantitative and quickly detection of Chinese cabbage clubroot.

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期刊信息
  • 《光谱学与光谱分析》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国光学学会
  • 主编:高松
  • 地址:北京海淀区魏公村学院南路76号
  • 邮编:100081
  • 邮箱:chngpxygpfx@vip.sina.com
  • 电话:010-62181070
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-0593
  • 国内统一刊号:ISSN:11-2200/O4
  • 邮发代号:82-68
  • 获奖情况:
  • 1992年北京出版局编辑质量奖,1996年中国科协优秀科技期刊奖,1997-2000获中国科协择优支持基础性高科技学术期刊奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国生物医学检索系统,美国科学引文索引(扩展库),英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:40642