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十字花科黑腐病菌分泌蛋白质双向电泳条件的构建及优化
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q51[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁530004, [2]广西理工科学实验中心,南宁530004, [3]广西大学生命科学与技术学院,南宁530004, [4]桂林医学院,桂林541004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31260443); 广西创新研究团队项目(2014GXNSFFA118005); 广西自然科学基金项目(2013GXNSFAA019097,2013GXNSFBA019088)共同资助
中文摘要:

本研究旨在建立一套适合于十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris 8004,Xcc8004)分泌蛋白质的双向电泳技术(two-dimensional electrophoresis,2-DE),以便更好的利用蛋白质组学技术鉴定Xcc 8004的分泌蛋白质。我们就MME和XCM2两种培养基对分泌蛋白质的诱导能力、蛋白质提取方法以及样品上样量等方面对2-DE的影响进行了比较,结果表明,XCM2培养基对Xcc 8004分泌蛋白质的诱导能力比MME强。用TCA/丙酮法沉淀蛋白质得到的双向电泳图谱背景清晰,分辨率高。分别采用400μg、300μg、250μg和150μg四个不同的上样量进行双向电泳,结果显示在上样量为250-300μg时(IPG pH 3-10,24 cm),电泳图谱分辨率最好。综上可知,XCM2培养基比较适合用于Xcc 8004分泌蛋白质的诱导,TCA/丙酮法提取分泌蛋白质为较优方法,250-300μg是较为合适的上样量。

英文摘要:

In order to establish a suitable and efficient two-dimensional electrophoresis(2-DE) technique for identifying the secreted proteins of Xanthomonas campestris pv. campestris 8004, the extracellular proteins on inducing media, MME and XCM2, different protein extraction methods, and loading amount on 2-DE profile were compared in this research. The results showed that XCM2 is more suitable for inducing extracellular proteins than that of MME, and clearer 2-DE maps can be observed while the proteins were precipitated by the TCA/acetone treatment. Furthermore, different loading amount(400 μg, 300 μg, 250 μg and 150 μg) of the proteins extracted by the method of TCA/acetone for 2-DE were used to optimize the conditions of sample preparation. As a result, the resolution and the quality of the 2-DE maps were most improved for proteins loading amount of 250μg to 300 μg separated in 24 cm IPG strips(pH 3-10). To sum up, XCM2 is suitable for inducing extracellular protein,TCA/acetone precipitation is much more suitable for protein extraction and 250-300 μg is the optimum loading amount of 2-DE for secreted proteins of Xanthomonas campestris pv. campestris.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299