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十字花科黑腐病菌hrpW基因的功能鉴定
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:《基因组学与应用生物学》
  • 时间:0
  • 分类:Q[生物学]
  • 作者机构:[1]广西大学生命科学与技术学院,南宁530004, [2]桂林医学院生物技术学院,桂林541004, [3]亚热带农业生物资源保护与利用国家重点实验室,南宁530004
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31260443)和广西自然科学基金项目(2013GXNSFBA019088.2014GXNSFFA118005)共同资助
中文摘要:

十字花科黑腐病菌(Xanthomonas campestris pv.campestris,Xcc)8004菌株基因组中XC_3023注释为HrpW蛋白基因。本研究利用生物信息学和分子生物学技术,对HrpW基因进行功能鉴定。生物信息学分析发现HrpW蛋白具有Harpin特征:含有果胶裂解酶结构域,为酸性蛋白,富含甘氨酸和丝氨酸。转录分析结果发现hrpW基因自身有一较弱的启动子,受MMX基本培养基诱导表达。共转录分析结果表明hrpW基因与上游hrp E、hpa B基因共同转录。Westem blotting和转运分析结果显示,HrpW蛋白受Ⅲ型分泌系统(type Ⅲ secretion system,T3SS)依赖分泌,但不转运。植株试验结果发现纯化的HrpW蛋白能在烟草上诱发过敏反应(hypersensitive reaction,HR)。这些结果揭示XC_3023编码蛋白HrpW为Ⅲ型分泌系统分泌的Harpin蛋白。

英文摘要:

XC_3023 ofXanthomonas campestris pv. campestris (Xcc) 8004 is annotated to encode HrpW protein. The bioinformatics and molecular biology methods were employed to identify the function of hrp W in this research. Bioinformatics analysis showed that HrpW harbors the characteristics of Harpin: containing pectate lyase domain, acidic protein, and rich of glycine and serine. The results of transcriptional expression analysis indicated that hrpW has a weak promoter and its expression is induced in minimal medium MMX. Co-expression assay revealed that hrpW is co-expressed with upstream hrpE and hpaB. The results of Western blotting and translocation detection demonstrated that HrpW is secreted but not translocated via type m secretion system (T3SS). Plant assay showed that the purified HrpW protein can elicit hypersensitive reaction (HR) in Nicotiana tabacum. All these results represented that HrpW is a T3SS-dependent Harpin protein.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299