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基于3种基因序列对百合属Leucolirion组的系统发育与种间关系研究
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:四川大学生命科学学院,生物资源与生态环境教育部重点实验室,成都610064
  • 相关基金:国家自然科学基金(31270241,31470009,31570198,31110103911); 国家基础条件平台; 国家标本平台教学标本子平台(http://mnh.scu.edu.cn); 科技部基础性研究专项(2013FY112100)
中文摘要:

中国拥有丰富的野生百合种质资源,但有关百合属的系统发育与进化关系研究相对较少。该研究基于ITS、cpDNA(trnV-ndhC、petL-psbE)及单拷贝核基因AKT等3个基因片段,选取特有分布于西南地区的百合属6个近缘类群共48份样本及GenBank获得的数据,对百合属Leucolirion组进行了系统发育与种间关系研究。结果表明:(1)ITS结果支持前人的处理,即将Leucolirion组细分为2个亚组,subsect.Leucolirion6a和subsect.Leucolirion6b。建议将湖北百合(L.henryi)和南川百合(L.rosthornii)归入到subsect.Leucolirion 6a,与泸定百合(L.sargentiae)、淡黄花百合(L.sulphureum)、宜昌百合(L.leucanthum)和岷江百合(L.regale)等4个种一起组成Leucolirion组;原本属于Archelirion组的野百合(L.brownii)与subsect.Leucolirion6b聚为一支,故将它与台湾百合(L.longiflorm)、麝香百合(L.formosanum)等组成一个新组,命名为百合组(sect.Lilium)。(2)组间关系上,Leucolirion组与百合组的系统发育关系较远,前者与分布于日本的Archelirion组形成姐妹类群,而后者与Sinomartagon组的亲缘关系更近。(3)基于叶绿体联合基因和单拷贝核基因AKT的6个近缘种的遗传距离显示,湖北百合与南川百合明显区别于Leucolirion组内拥有白色管状花的4个类群。叶绿体联合基因树和单拷贝核基因树结果表明,泸定百合、淡黄花百合、岷江百合和宜昌百合在遗传水平上表现出了极高的相似性,遗传关系十分相近,这可能与百合属植物特殊的繁育系统有关,影响了物种间遗传变异与分化。

英文摘要:

Despite abundant germplasm resources of wild lilies in China,the study of phylogenetic and interspecific relationship in Lilium was scarce.In this study,phylogeny of the section Leucolirion Comber which includes GenBank data and 48 specimens covering 6closed related lilies endemic to Southwest China was explored based on ITS,cpDNA and a single-copy nuclear gene,AKT.The results showed that:(1)in accordance with previous studies that the section Leucolirion Comber should be divided into two subsec-tion,subsect.Leucolirion6 aand subsect.Leucolirion6 b,and L.henryi and L.rosthornii should be classified into subsect.Leucolirion 6a.We revise section Leucolirionincluding L.sargentiae,L.sulphureum,L.leucanthum,L.regale,L.henryi and L.rosthornii.L.bownii,which originally belonged to section Archelirion was placed into subsect.Leucolirion6 b,along with L.formosanumand L.longiflorum,we establish a new group,named section Lilium.(2)As for infrageneric relationships,section Archelirion which mainly distributes in Japan showed a sister relationship with section Leucolirion.However,section Liliumand Sinomartagonshowed a close relationship.(3)The genetic distances among all taxa of chloroplast combination and AKTshowed that L.henryi and L.rosthornii distinctly differ from other members of section Leucolirion.Phylogenetic tree based on chloroplast combination data,AKTfragment indicated that L.sargentiae,L.sulphureum,L.regale and L.leucanthumhave a very close relationship.High genetic similarity between these species may be attributed to the particular mating system of Lilium,leading to limited genetic variation and differentiation among species.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104