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利用PCR-DGGE技术分析猪粪堆肥细菌群落结构
  • ISSN号:1000-2367
  • 期刊名称:《河南师范大学学报:自然科学版》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.9[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]商丘师范学院生命科学系,河南商丘476000, [2]华中农业大学动物科技学院,湖北武汉430070, [3]华南理工大学环境科学与工程学院污染控制与生态修复广‘东省高校重点实验室,广东广州510006
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(30471271); 国家科技支撑计划“生态循环健康养猪关键技术研究与产业化示范”(2006BAD14B05-2); 河南省教育厅自然基金资助项目(2010B530001)
中文摘要:

采用玻璃珠法从高温堆肥样品中进行了微生物总DNA的提取,以细菌16S rRNA基因V3区通用引物进行了PCR扩增,随后用变性梯度凝胶电泳(DGGE)技术对其微生物多样性进行评估.结果表明,玻璃珠法能够快速、有效地获得高质量的堆肥微生物总DNA,所得的DNA分子片段在15kb以上,使用细菌16S rRNA基因通用引物(27F和1492R)对总DNA进行PCR扩增,获得了近全长的16S rDNA序列(约1.5kb);DGGE分析结果表明,用该方法提取到的DNA种类较为丰富,多样性较好,能够进一步应用于群落结构分析.因此,玻璃珠法提取的DNA可以用于堆肥微生物的分子生态学研究及微生物群落结构分析.

英文摘要:

Total DNA of the hot composting microorganism was directly extracted by glass beads method,and bacterial 16S rRNA genes were amplified with a pair of universal primers of the 16S rRNA gene V3 region by polymerase chain reaction(PCR),then the diversity of the amplification products was evaluated by DGGE technology.The results indicaed that glass beads can extract microorganism total DNA from hot composting quickly,molecular size of DNA obtained using this protocol was about 23kb and a eubacterial 16S rRNA gene targeted primer pair(27F and 1492R) was used for PCR amplificaion,and got almost the full length 16S rDNA sequence(about 1.5 kb).The results of DGGE analysis indicated that the DNA from the hot composting has high population diversity,and has further application in the community analyses.So the microbial DNA extracted by using glass beads could be used for molecular ecological study and community analyses.

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期刊信息
  • 《河南师范大学学报:自然科学版》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:河南师范大学
  • 主办单位:河南师范大学
  • 主编:王记录
  • 地址:河南省新乡市建设东路46号
  • 邮编:453007
  • 邮箱:
  • 电话:0373-3329394 3329272
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-2367
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1109/N
  • 邮发代号:36-55
  • 获奖情况:
  • 国家新闻出版局、国家科委优秀学报奖,河南省科委、河南省教委优秀学报
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,德国数学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7535