位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区序列特征分析
  • ISSN号:1000-5684
  • 期刊名称:吉林农业大学学报
  • 时间:0
  • 页码:208-213
  • 语言:中文
  • 分类:S828[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]吉林大学畜牧兽医学院,长春130062, [2]黑龙江八一农垦大学动物科技学院,大庆163319, [3]沈阳农业大学畜牧兽医学院,沈阳110161, [4]吉林省农业科学院畜牧分院,公主岭136100
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30771543),“863”项目(2008AA10Z136),吉林省科技发展计划项目(20070567)
  • 相关项目:猪IGF-I基因不同转录子结构及在肌肉组织中表达规律的研究
中文摘要:

对松辽黑猪类胰岛素样生长因子-Ⅰ(IGF-Ⅰ)基因5′调控区进行了T-A克隆和序列测定,在分析序列结构特征的基础上与GenBank中野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊进行了比较基因组学和系统进化研究。结果表明:松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区存在C/EBPb、MATal、Oct-1、CF-1等多个潜在的转录因子结合位点,可能与IGF-Ⅰ的转录调控和起始以及特异表达有关。在该非编码序列中,重复序列所占比率为2.22%,不存在SINEs、LINEs、LTR类反转录元件和DNA转座子元件,而发现存在1个(CA)18微卫星位点。在松辽黑猪IGF-Ⅰ基因5′调控区,松辽黑猪与野猪、大白猪、牛、山羊、绵羊各物种间同源性大小分别为99.0%、98.8%、90.7%、91.6%、90.6%。MUPD法构建的分子系统进化树聚类结果表明,野猪与大白猪先聚为一类,再与松辽黑猪聚类形成一个大分支,而山羊和绵羊先聚成一类,再与牛聚类形成一个大分支,然后再与猪的一支汇合在一起。

英文摘要:

The 5'-Regulatory region sequence of the IGF- Ⅰ gene in Songliao black pig was cloned by T - A method. Characterization and comparison of this sequence with Sus scrofa, White landrance, cat- tle,goat and sheep were also conducted. Results showed that: the 5'-Regulatory region contained many potential transcriptional factor binding sites such as those for C/EBPb, MATal, CF-1,and Oct-1, which might have an important effect on transcription activation and regulation as well as tissue-specific expres- sion. The rate of repetitive sequences was 2.22 % and no SINEs, LINEs, LTR anti-transcription ele- ments or DNA transposon elements were found, although one(CA)18 mierosatellite was found. In the 5' regulatory region, sequence homology between Songliao black pig and Sus scrofa, White landrance, cattle, goat and sheep was 99.0%, 98.8%, 90.7%, 91.6% and 90.6%, respectively. The molecular phylogenetic tree among these species, constructed by the MUPD method based on the sequences of 5' regulatory region of the IGF- Ⅰ gene, placed the Sus scrofa and White landrance on one branch and the Songliao black pig on the other. Goat and sheep were joined first, followed by the cattle.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《吉林农业大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:吉林省教育厅
  • 主办单位:吉林农业大学
  • 主编:秦贵信
  • 地址:吉林省长春市新城大街2888号
  • 邮编:130118
  • 邮箱:jlndxb@vjlav.edu.cn
  • 电话:0431-84532914
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-5684
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1100/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 全国优秀科技期刊,全国中文农业类核心期刊,中国科技论文统计源期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16398