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基于ITS和trnL—F以及rps4基因片段的粗疣藓属分类学地位研究
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:《西北植物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q789[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]华东师范大学生命科学学院,上海200241, [2]河北师范大学生命科学学院,石家庄050024
  • 相关基金:国家自然科学基金(31270255)
中文摘要:

摘要;选择粗疣藓属及相关属样本作为内群,油藓属样本作为外群,选取核基因ITS片段以及叶绿体基因trnL厂F和rps4片段进行PCR扩增、测序,运用贝叶斯推论(BI)、最大似然法(ML)和最大简约法(MP)构建分子系统发育树,以明确粗疣藓属的分类学地位。结果表明:(1)用于分子系统分析的基因序列共有1744个位点,其中747个位点属于核基因片段,997个位点属于叶绿体基因片段。(2)3种系统发育树拓扑结构基本一致,都显示粗疣藓属与毛锦藓科成员聚成一支,支持粗疣藓属应隶属于毛锦藓科的观点。(3)小粗疣藓和粗疣藓的种间界限模糊。(4)小鼠尾藓属的3个种与棉藓属成员聚成一支,支持将其归入棉藓科的观点。

英文摘要:

To clarify the obscured taxonomic status of Fauriella Besch. ,we carried out phylogenetic analyses inferred from cp trnL-F,rps4 and nr ITS,with increased samples of Fauriella and related genera,and Hookeria Sin. selected as outgroup. The phylogenetic trees were conducted by Bayesian analyses, ML analyses, and MP analyses. The results were as follows : (1) The final alignment used for phylogenetic analyses contained 1 744 positions,including 747 nuclear region positions and 997 plastid positions~ (2)There was no significant topological conflict among the consensus trees,which showed that Fauriella clustered with the members of Pylaisiadelphaceae and indicated that Fauriella should be put into Pylaisiadelphaceael (3)The relationship between Fauriella tenerrima Broth. and Fauriella tenuis (Mitt.) Cardot is obscured; (4) 3 species of Myurella Brueh Schimp. are clustered with the members of Plagiotheciurn Bruch Schimp. , which is congruent with the point that Myure!la should be transferred to Plagiotheciaceae.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104