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利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法探讨
  • ISSN号:1673-6273
  • 期刊名称:现代生物医学进展
  • 时间:2011
  • 页码:618-623
  • 分类:Q75[生物学—分子生物学] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]首都儿科研究所,北京100020
  • 相关基金:科技部973项目(2007CB511901); 国家自然科学基金(81000249/H0417); 北京市卫生局青年科学研究资助项目基金(2010-2012)
  • 相关项目:神经管畸形中LINE-1甲基化修饰与基因组的稳定性
中文摘要:

目的:探讨利用分子量阵列平台进行特定序列甲基化分析的方法。方法:通过对不同扩增条件和扩增效率及不同条件处理的质谱分析比较了MassArray平台进行甲基化分析的特点。结果:本研究通过与重亚硫酸盐测序结果比较证实,MassArray分子量阵列技术平台能够反映甲基化修饰的真实水平;通过不同条件下PCR扩增效率与甲基化分析的结果,发现扩增效率是制约MassArray分子量阵列技术平台甲基化分析的关键因素,而产物的放置时间和不同的处理没有明显影响甲基化分析。结论:Mas-sArray甲基化分析平台是高效快速检测甲基化修饰的平台,在使用过程中应该根据实际的实验条件,进行合理的质控。

英文摘要:

Objective:To investigate the methods of specific methylation modification by massarray platform.Methods:Charac-ters of MassArray platform were analyzed by comparing the test efficiency under different amplify and treatment conditions.Results:MassArray platform could detect a real methylation modification of gene by comparing with bisulfite sequencing.By comparing different amplifications,PCR efficiency was a key point for methylation analysis on this platform,while no significant difference was established on standing time and treatments after PCR.Conclusions:MassArray platform is a powerful tool for methylation analysis,quality control according to characters of fragment is needed for this platform.Our research provided fundamentals for further methylation studies using MassArray platform.

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期刊信息
  • 《现代生物医学进展》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:黑龙江省卫生厅
  • 主办单位:黑龙江省红十字医院 黑黑龙江省红十字医院 黑龙江省森林工总医院
  • 主编:申宝忠
  • 地址:哈尔滨市南岗区花园街184号403
  • 邮编:150001
  • 邮箱:biomed_54@126.com
  • 电话:0451-82583800 53658268
  • 国际标准刊号:ISSN:1673-6273
  • 国内统一刊号:ISSN:23-1544/R
  • 邮发代号:14-12
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 被引量:33230