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基于RNA-seq的黄肉猕猴桃类胡萝卜素合成相关基因的表达分析
  • ISSN号:1009-9980
  • 期刊名称:果树学报
  • 时间:2015.3
  • 页码:404-412+521
  • 分类:S663.4[农业科学—果树学;农业科学—园艺学]
  • 作者机构:[1]江西农业大学农学院
  • 相关基金:国家自然科学基金(31160385);江西省自然科学基金(20122BAB214023);江西省科技支撑计划(20121BBF60022)
  • 相关项目:中华猕猴桃果肉色泽相关基因克隆及其定量表达分析
中文摘要:

【目的】探讨黄肉猕猴桃发育过程中果实类胡萝卜素合成途径中相关差异基因的功能。【方法】以黄肉型中华猕猴桃‘金丰’果实为试材,在前期RNA-seq测序的基础上,利用实时荧光定量PCR技术检测其类胡萝卜素合成过程中相关差异基因的表达水平。【结果】Unigene23885、CL10798、Unigene11266、CL1511四个基因相对表达量较高,其他基因表达量相对较低;相关性分析结果显示,类胡萝卜素含量与Unigene11266、Unigene23885、Unigene2673三个基因相对表达量显著相关,与基因Unigene23823、Unigene12775相对表达量呈极显著相关。聚类分析结果显示,基因Unigene23885和Unigene11266、基因CL1511和CL10798分别被聚为一类,其表达模式非常接近且与其他基因明显不同,并在类胡萝卜素合成中高水平表达,基因CL10467与其距离最近。【结论】综合相关性分析和聚类分析,基因Unigene11266、Unigene23885可能是类胡萝卜素合成的关键基因,且较其他基因而言,基因CL10467、Unigene12775、CL10798、CL1511、Unigene2673与其关系更密切。

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期刊信息
  • 《果树学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:农业部
  • 主办单位:中国农业科学院郑州果树研究所
  • 主编:王志强
  • 地址:河南省郑州市航海东路南中国农业科学院郑州果树研究所
  • 邮编:450009
  • 邮箱:chinagsxb@163.con
  • 电话:0371-65330928 653387308
  • 国际标准刊号:ISSN:1009-9980
  • 国内统一刊号:ISSN:41-1308/S
  • 邮发代号:36-93
  • 获奖情况:
  • 获河南省优秀期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:18699