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山羊瘤胃产甲烷古菌多样性及与其他动物瘤胃的比较
  • ISSN号:0366-6964
  • 期刊名称:《畜牧兽医学报》
  • 时间:0
  • 分类:S827[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医] S811.5[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]南京农业大学动物科技学院消化道微生物研究室,南京210095, [2]山西农业大学动物科技学院,太谷030801
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(30530560)
中文摘要:

旨在研究山羊瘤胃产甲烷古菌的多样性并与其他动物瘤胃进行比较。采用产甲烷菌特异性引物Met86F/Metl340R研究山羊瘤胃产甲烷古菌16SrRNA基因的多样性,随机挑选100个克隆进行序列分析。结果表明,所有克隆经限制性内切酶酶切后共获得16个OTU,绝大多数为甲烷短杆菌,其中与甲烷短杆菌菌株AK-87、ZA-10、OCP、SM9和30Y序列最相近的克隆数分别为58%、19%、7%、2%和2%,还有与Methanos phaera stadtmanae(1%)、Metha-nobacterium aarhusense(2%)、Acidulipro fundum boonei(3%)、Methanobrevibacter sp.AK-87(4%)和Methanobrevibactersp.1Y(2%)等相似的古菌序列。将研究结果与已经报道的关于牛和绵羊瘤胃产甲烷菌多样性比较,发现不同PCR引物可检测出不同菌群结构,而饲料类型、动物种类可影响瘤胃产甲烷菌的菌群结构。

英文摘要:

This experiment was conducted to study the molecular diversity of rumen methanogens from goat and its comparison with other ruminant. The methanogen-specific primers Met86F/ Met1340R was used to analyze the 16S rRNA gene diversity of methanogens. One hundred clones were randomly picked up for sequence analysis. The result showed that sixteen OTUs were ob- tained after RFLP analysis, and the majority belonged to the Methanobrevibacter strains, AK-87 (58%), and others to ZA-10 (19%), OCP (7%), SM9 (2%), and 30Y(2%), and Methano- sphaera stadtmanae-like (1%) , Methanobacterium aarhusense-like (2%) , aciduli pro f undum boonei-like (3 %), Methanobrevibacter sp. AK-87-1ike (4%) and Methanobrevibacter sp. 1Y-like (2%) sequences, respectively. With comparison to ported in previous studies, the rumen can be affected it can be concluded that by the different primers, rumen methanogens from other ruminants re- the structure of methanogenic communities in feed types and animal species.

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期刊信息
  • 《畜牧兽医学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国畜牧兽医学会
  • 主编:文杰
  • 地址:北京海淀区圆明园西路2号中国农科院畜牧所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:xmsyxb@263.net
  • 电话:010-62815987 62816996
  • 国际标准刊号:ISSN:0366-6964
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1985/S
  • 邮发代号:82-453
  • 获奖情况:
  • 1992年北京优秀期刊奖,1998年、2000年在全国畜牧兽医优秀期刊评比中获一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),瑞典开放获取期刊指南,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21857