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趋化因子CXCL9基因SNPrs2276886与系统性红斑狼疮相关性研究
  • ISSN号:1007-7480
  • 期刊名称:《中华风湿病学杂志》
  • 时间:0
  • 分类:R457[医药卫生—治疗学;医药卫生—临床医学] R593.241[医药卫生—临床医学;医药卫生—内科学]
  • 作者机构:[1]上海交通大学医学院附属仁济医院风湿免疫科上海市风湿病研究所,上海200001, [2]中国科学院上海生命科学院,上海交通大学医学院健康科学研究所
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金重点资助项目(30471613);上海市重点学科建设项目(T0203);上海市科学技术委员会科研计划基金资助项目(05ZR14136,06JC14050)
中文摘要:

目的分析趋化因子CXCL9基因SNPrs2276886在中国汉族人群中的分布情况以及与系统性红斑狼疮(SLE)遗传易感性的关系。方法①抽提482例SLE患者[其中包括253例狼疮肾炎(LN)患者]外周血DNA,经聚合酶链反应(PCR)扩增后,通过Pyrosequencing法进行等位基因分型。②80例患者同时留取RNA样本并反转录为cDNA,以实时荧光定量PCR方法检测CXCL9基因的表达水平。结果SLE组和LN组等位基因T的频率高于正常对照组(OR分别为1.346和1.347,P〈0.05),Tr基因型的频率也显著高于正常人群(X^2分别是6.397和3.941,P〈0.05)。CXCL9mRNA在rs2276886 TT型个体中的表达(3.9±2.0)高于CC型纯合子(2.5±2.1),P〈0.05。结论证实了中国人群中CXCL9基因SNPrs2276886作为一种遗传因素影响对疾病的易感性,等位基因T对于SLE是一种遗传易感标记。该SNP可能从转录水平上决定了基因的分泌水平,从而参与SLE的发病。

英文摘要:

Objective To determine the association of chemokine CXCL9 SNPrs2276886 with systemic lupus erythematosus (SLE) in a case-control study of Chinese population. Methods A total of 482 SLE patients (including 253 patients with lupus nephritis) were compared with 216 control subjects. DNA of peripheral blood were extracted and CXCL9 SNPrs 2276886 in intron 1 were genotyped by pyrosequencing methods. In addition, total RNA of 80 SLE patients was extracted and transcribed into cDNA. Sybr green dye based real-time quantitative PCR method was used to compare the expression levels (indicated as-AACt value) of CXCL9. Results Frequencies of the T allele were significantly higher in patients with SLE (OR 1.346, P〈0.05) and lupus nephritis (OR 1.347, P〈0.05). And the TT genotype also showed significant association with SLE (X^2=6.397, P〈0.05) and lupus nephritis (X^2=3.941, P〈0.05). The expression of CXCL9 mRNA in genotype TT group was 3.9±2.0, higher than 2.5±2.1 in genotype CC group, P〈0.05. Conclusion The T allele of CXCL9 SNPrs2276886 is associated with increased SLE risk. This allele can act as a hereditary label of SLE. This gene polymorphism loci may influence mRNA expression and implicate the pathogenesis of systemic lupus erythematosus.

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期刊信息
  • 《中华风湿病学杂志》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中华医学会
  • 主编:
  • 地址:山西省太原市东华门23号
  • 邮编:030013
  • 邮箱:cmafsb@163.com
  • 电话:0351-7553295 7553182
  • 国际标准刊号:ISSN:1007-7480
  • 国内统一刊号:ISSN:14-1217/R
  • 邮发代号:22-153
  • 获奖情况:
  • 1998年,《中华风湿病学杂志》社被共青团省委、山...,1999年获山西省第二届书刊装帧艺术作品一等奖,1999—2002年被评为山西省一级期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:16745