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药物分子对接网格研究与进展
  • ISSN号:1000-8608
  • 期刊名称:《大连理工大学学报》
  • 时间:0
  • 分类:TP391.75[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]大连理工大学工业装备结构分析国家重点实验室,辽宁大连116024
  • 相关基金:国家“九七三”高技术研究发展资助项目(G1999032805);国家自然科学基金资助项目(10272030).
中文摘要:

药物分子对接所涉及的搜索空间非常巨大,需要耗费大量的时间,并且对计算环境也有较高的要求.将网格技术应用于药物分子对接中,能有效解决上述问题.通过应用改进的遗传算法多种群竞争机制的对接演化模型GADock,以信息熵控制设计空间的收缩,增强了进化的有效性,显著地提高了对接效率、利用网格数据传输和网格任务调度等网格技术对分子对接过程进行了优化,有效利用了网格节点资源,并降低了药物分子的对接时间.实例测试表明了药物分子对接与网格技术相结合的合理性及有效性.

英文摘要:

Rigid conditions such as searching space, spending time and computing environment are required by drug molecular docking design, which can be satisfied through combining drug molecular docking design with grid techniques. An improved genetic algorithm docking method, GADock, is presented, which is based on multi-species competition mechanism. And this informational entropy will be used to control the design space narrowing down, so the evolutional reasonability and docking efficiency are all improved greatly. Then two correlative grid techniques, grid data transferring and grid task scheduling, are introduced, through which the docking time is reduced and the grid resources are used more efficiently. The results of example tests have shown that the combination of drug molecular docking design and grid techniques is efficient and reasonable.

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期刊信息
  • 《大连理工大学学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:教育部
  • 主办单位:大连理工大学
  • 主编:程耿东
  • 地址:大连理工大学学报编辑部
  • 邮编:116024
  • 邮箱:xuebao@dlut.edu.cn
  • 电话:0411-84708608
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-8608
  • 国内统一刊号:ISSN:21-1117/N
  • 邮发代号:8-82
  • 获奖情况:
  • 国家“双百”期刊,1997年获首届中国期刊奖提名奖、获第二届全国优秀...,1992年获全国优秀科技期刊评比三等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),美国数学评论(网络版),波兰哥白尼索引,德国数学文摘,荷兰文摘与引文数据库,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:15881