发展基于哈密尔顿体系的分子动力学辛算法体系,研究基于异步并行的分子动力学快速高效算法,适于分子对接设计的演化算法、模拟退火算法和神经网络等智能类算法,并与传统优化算法结合,研制出快速高效的构象分析和优化设计并行算法。将上述研究成果融入药物分子设计,改进现有的药物分子计算机辅助设计软件,提高计算效率以适应新药研制的需要。
英文主题词molecular docking; optimization design; parallel computation; genetic algorithm; grid computing