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新疆艾比湖湿地博乐河入口处土壤细菌多样性分析
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:微生物学通报
  • 时间:2014.11.20
  • 页码:2244-2253
  • 分类:Q939.1[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]石河子大学生命科学学院,新疆石河子832003
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.31160026); 石河子大学高层次人才科研启动资金专项项目(No.RCZX201010)
  • 相关项目:艾比湖湿地微生物多样性和群落结构动态演替及其对环境响应的研究
中文摘要:

【目的】了解新疆艾比湖湿地国家级自然保护区非培养土壤细菌群落组成及多样性。【方法】采用非培养法直接从湿地土壤提取总DNA进行16S r RNA基因扩增,构建细菌16S r RNA基因克隆文库。使用MspⅠ和AfaⅠ限制性内切酶对阳性克隆进行16S r RNA基因扩增片段的限制性酶切分析(Amplified r DNA restriction analysis,ARDRA),挑取具有不同双酶切图谱的克隆进行测序,序列比对并构建16S r RNA基因系统发育树。【结果】从土壤细菌的16S r RNA基因文库中随机挑取75个不同谱型的克隆子,共得到58个OTUs,系统发育归类为8个细菌类群:绿弯菌门(Chloroflexi)、蓝藻门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)、拟杆菌门(Bacteroidetes)、疣微菌门(Verrucomicrob)和芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)。其中,变形菌门为第一优势菌群,拟杆菌门为第二优势菌群,两者约占总克隆的65%。【结论】艾比湖湿地博乐河入口处土壤细菌多样性丰富,且存在一定数量的潜在微生物新种。

英文摘要:

[Objective] In order to investigate bacteria diversity and community composition in Bole river entrance soil of the Ebinur Lake wetland National Nature Reserve,Xinjiang.[Methods] Total DNA was directly extracted from the soil of the Ebinur Lake wetland Bole river entrance using the culture independent method.16 S r RNA gene was amplified using bacterial primer set Eubac27 F and Eubac1492 R.16 S r RNA gene clone library was constructed.Positive clones were identified by amplified r DNA restriction analysis(ARDRA) using Msp I and Afa I,and unique r DNA pattern clones were sequenced,analysed,and then the phylogenetic tree was constructed.[Results] Seventy-five different clones of Macrorestriction Map was classified into 58 operational taxonomic units(OTUs),which were associated with 8 phyla by phylogenetic analysis,including Chloroflexi,Cyanobacteria,Proteobacteria,Firmicutes,Actinobacteria,Bacteroidetes,Verrucomicrob and Gemmatimonadetes.Among them,the most abundant phyla was Proteobacteria,followed by Bacteroidetes,accounting for about 65% of the total clones.[Conclusion] The bacterial diversity is abundant in the Ebinur Lake wetland Bole river entrance soil,and exist a certain amount of new unknown taxon in this environment.

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487