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艾比湖湿地三种植物根际土壤氨氧化细菌群落的多样性
  • ISSN号:0001-6209
  • 期刊名称:微生物学报
  • 时间:2015
  • 页码:1190-1200
  • 分类:Q938[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]石河子大学生命科学学院,新疆石河子832000
  • 相关基金:国家自然科学基金(31160026); 石河子大学高层次人才科研启动资金专项项目(RCZX201010)~~
  • 相关项目:艾比湖湿地微生物多样性和群落结构动态演替及其对环境响应的研究
中文摘要:

【目的】以艾比湖湿地盐节木(Halocnemum strobilaceum)、芦苇(Reed)及盐角草(Salicornia)三种植物为对象,研究其根际土壤氨氧化细菌(AOB)的群落多样性。【方法】利用PCR-RFLP的方法,构建氨氧化细菌amo A基因克隆文库,进行系统发育分析。结合三种植物根际理化因子特点,探讨三种植物根际AOB群落结构组成的特点。【结果】通过序列多态性分析表明,三种植物根际土壤AOB amo A基因克隆文库中的所有序列均属于β亚纲(β-Proteobacteria)中的亚硝化单胞菌属(Nitrosomonas)及Nitrosomonas-like,未发现亚硝化螺菌属(Nitrosospira)。三个AOB amo A基因克隆文库分别包括9个OTUs、12个OTUs和7个OTUs,其文库覆盖度均达99%以上,代表性强。三个文库的丰富度、Chao1指数、ACE指数、Shannon指数均为R〉H〉S。【结论】三种植物的AOB多样性为芦苇〉盐节木〉盐角草,并且其最优氨氧化菌群各不相同。本研究为系统认识艾比湖湿地植物根际氨氧化细菌群落多样性和结构组成提供了基础。

英文摘要:

[ Objective ] In order to study the community diversity of rhizosphere soil ammonia-oxidizing bacteria, Halocnemum strobilaceum, Reed and Salicornia in Ebinur Lake Wetland were investigated. [ Methods] The clone libraries of amoA gene were constructed by polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) , and phylogenetics were analyzed. To explore the community structure of rhizosphere amomonia-oxidizing bacteria, we combined rhizosphere physicochemical factors of the three plants. [ Results] Phylogenetic analysis of the amoA gene fragments showed that all of AOB sequences from shrimp of three plants rhizosphere were affiliated with Nitrosomonas or Nitrosomonas-like phyla, Nitrosospira phyla was not discovered. Three plants rhizosphere composition includes 90TUs, 12 OTUs and 70TUs respectively. Coverages of all libraries of the three plants rhizosphere were over 99% and strongly representative. The richness index, ehaol index, ACE index and Shannon index of the three libraries were as follows, Reed rhizosphere AOB was much higher than Halocnemum strobilaceum rhizosphere AOB, and Salicornia rhizosphere AOB was the lowest. [ Conclusion] This study provides a basis for understanding the community diversity and structure of rhizosphere soil ammonia-oxidizing bacteria in Ebinur Lake wetland.

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期刊信息
  • 《微生物学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国微生物学会 中国科学院微生物研究所
  • 主编:谭华荣
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路3号中国科学院微生物研究所B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:actamicro@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807516
  • 国际标准刊号:ISSN:0001-6209
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1995/Q
  • 邮发代号:2-504
  • 获奖情况:
  • 国家优秀期刊二等奖,中科院优秀期刊二等奖,中国科协首届优秀科技期刊二等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国生物医学检索系统,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:21879