位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
家蚕真核翻译起始因子3f基因结构与表达研究
  • ISSN号:0257-4799
  • 期刊名称:《蚕业科学》
  • 时间:0
  • 分类:S881.2[农业科学—特种经济动物饲养;农业科学—畜牧兽医] Q78[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]浙江大学动物科学学院,杭州310029
  • 相关基金:国家高技术研究与发展计划“863”项目(编号2006AA10214-2),国家重点基础研究发展计划“973”项目(编号2005CB121-003),国家自然科学基金项目(编号30370805,B30080023).
中文摘要:

在对家蚕5龄丝腺cDNA文库测序的过程中,发现一个编码家蚕翻译起始因子基因(eIF3f)的EST序列。利用电子克隆、3′RACE(3′rapid amplification of cDNA ends)方法克隆了家蚕eIF3f基因cDNA序列全长,命名为eIF3f(GenBank登录号为DQ868530)。家蚕eIF3f基因cDNA全长为1009bp,由870bp的开放阅读框序列(open reading frame,ORF)、55bp的5′端非翻译区序列(5′-UTR)和65bp的3′端非编码区序列(3′-UTR)组成,编码289个氨基酸。氨基酸序列比较分析显示,家蚕eIF3f与其他物种的eIF3f都具有翻译起始功能所必需的JAB—MPN结构域。家蚕eIF3f基因组结构分析:该基因由5个外显子和4个内含子组成;5′调控序列存在E74A、DFD、DRI等多个潜在的转录因子结合位点,但没有TATA盒启动子序列。家蚕eIF3f基因的表达在不同组织和不同发育时期存在差异,eIF3f是一种负调控翻译起始因子。研究结果有助于进一步研究真核翻译起始因子的相关基因调控规律。

英文摘要:

According to silkworm EST generated by the large-scale cDNA sequencing in our lab, we found an EST which is highly homologous to the eIF3f. By using the methods of electronic clone and 3′RACE, a full-length cDNA, named as eIF3f (GenBank accession number DQ868530) was isolated from silkworm, which is 1 009 bp nucleotide long, and contains an ORF(870 bp) encoded 289 amino acids, 55 bp nucleotide sequence in 5′UTR and 65 bp nucleotide sequence in 3'-UTR. The deduced amino acids showed a high degree of similarity to the previously reported eIF3fs and shared a conserved JAB-MPN domain which is essential for the translation initiation. Genomic structure analysis suggested that eIF3f contains 5 exons and 4 introns. In the 5′upstream, many potential binding sites for the transcription factors were detected, such as E74A, DFD, DRI etc, but no TATA box. The expression level of eIF3f gene at different stages and in different tissues were different. The results implied that eIF3fis a negative regulator of translation initiation. The above results will be helpful to elucidate the regulation principle of expression of genes related to eukaryotic translation initiation factors.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《蚕业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学技术协会
  • 主办单位:中国蚕学会 中国农业科学院蚕业研究所
  • 主编:郭锡杰
  • 地址:江苏省镇江市四摆渡中国农业科学院蚕业研究所
  • 邮编:212018
  • 邮箱:CYKE@chinajournal.net.cn
  • 电话:0511-85616835
  • 国际标准刊号:ISSN:0257-4799
  • 国内统一刊号:ISSN:32-1115/S
  • 邮发代号:28-23
  • 获奖情况:
  • 中国科协优秀科技期刊,全国农业学会优秀期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:7742