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海南岛青梅AFLP标记的遗传多样性
  • ISSN号:1001-7488
  • 期刊名称:《林业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q943[生物学—植物学] S718.46[农业科学—林学]
  • 作者机构:[1]华南农业大学林学院,广州510642, [2]中国林业科学研究院热带林业研究所,广州510520
  • 相关基金:科技部科技基础平台项目“野生植物资源保护与可持续利用”子项目(2003DIA3N024)和科技部、国家林业局海南尖峰岭国家级森林生态系统定位研究站基础条件平台支撑项目的一部分研究内容.中国科学院华南植物园李忠超先生在文稿的撰写过程中给予细致帮助,特此致谢.
中文摘要:

采用AFLP标记检测海南岛青梅7个主要自然居群192株个体的遗传多样性及遗传结构。应用筛选出的6对引物共扩增出频率大于5.00%的位点777个,其中多态位点比例为99.61%(774)。在种级水平上,Nei’s基因多样性指数(H)为0.2661,Shannon多态性信息指数(I)为0.4204;总基因多样度(Ht)为0.2684。居群水平的平均多态性位点数和多态性比例为617个和79.45%;H和I平均值分别为0.2153和0.3352。遗传分化指数(Fst)和基因流(Nm)分别为0.1980和1.0127。UPGMA聚类和遗传距离与空间距离相关性分析结果表明,居群间遗传亲缘关系与其地理位置关系不明显(P=0.2300,r^2=0.2325)。综合研究结果表明,青梅具有较高的遗传多样性,居群间有一定的遗传分化。建议采取人工促进天然林下层苗木生长和人工造林等措施,促进现有青梅居群遗传多样性保育和发展。

英文摘要:

Genetic variation and structure of seven populations of Vatica mangachapoi on Hainan Island were investigated by Amplified Fragment Length Polymorphism (AFLP) method. A total of 777 highly reproducible and discernible loci (frequency 〉 5.00% ) were generated from 192 individuals of 7 natural populations with 6 primer combinations, of which polymorphic loci were 99.61 %. On the species level, total gene diversity ( Ht ) was 0. 268 4; Nei's gene diversity (H) and Shannon information index (I) were 0.266 1 and 0.420 4 respectively. On the population level, mean percentage and number of polymorphic loci were 79.45% and 617 respectively; the means of H and I were 0.215 3 and 0.335 2 respectively. The gene flow (Nm) was 1 .012 7, and there existed 80.20% of genetic variance within populations (Fst = 0. 198 0). The UPGMA analysis and mantel test showed that there was no significant correlation between genetic distance and geographic distance ( r^2 = 0.232 5, P = 0.230 0). The results showed that V. mangachapoi possessed high genetic diversity on both population and species levels and a certain genetic differentiation among the populations. It is suggested that the conservation and development of existing genetic diversity of V. mangachapoi should be enhanced by suitable human interferences and afforestation approaches.

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期刊信息
  • 《林业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科协
  • 主办单位:中国林学会
  • 主编:尹伟伦
  • 地址:北京万寿山后中国林学会
  • 邮编:100091
  • 邮箱:lykx@vip.sina.com
  • 电话:010-62889820
  • 国际标准刊号:ISSN:1001-7488
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1908/S
  • 邮发代号:82-6
  • 获奖情况:
  • 在三届"国家期刊奖"评选中,两次荣获中国期刊最高奖-"国家期刊奖",一次名列"国家期刊奖提名奖"第一名
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:42472