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光诱导香菇菌丝转色阶段的转录因子表达分析
  • ISSN号:1672-6472
  • 期刊名称:《菌物学报》
  • 时间:0
  • 分类:S511.03[农业科学—作物学]
  • 作者机构:[1]国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所,上海201403, [2]上海海洋大学食品学院,上海201306
  • 相关基金:国家自然科学基金面上项目(31170098);上海市科技人才计划项目(13XIM24700)
中文摘要:

根据香菇单核菌丝体135A 和135B 的全基因组测序,通过生物信息学方法分析筛选出香菇功能基因 CAP、GLA1、TLG1结构域中的非同义 SNP 位点,开发出3对 SNP-CAPS 分子标记。结果表明:这3对功能基因SNP-CAPS 分子标记可将23个香菇单核体供试菌株分成135A 型(分别为16株、20株、2株)和135B 型(分别为7株、3株、21株),这些标记表现出的多态性为进一步研究香菇菌株的来源和功能基因的定位提供参考价值;并建立起可以简单、快速、准确地调查重要功能基因的 SNP 位点变异情况的方法。

英文摘要:

Based on the whole genome sequencing of monokaryon strain of Lentinula edodes 135A and 135B,the non-synonymous SNP loci within the domain of the CAP,GLA1,TLG1 genes were found by using the bioinformatics way,and developed into three pairs of primers as SNP-CAPS molecular markers.The results showed that these SNP-CAPS markers could divide 23 tested monokaryons strains of L.edodes into two groups:135A type(corresponding 16,20 and 2 strains)and 135B type(corresponding 7,3 and 21 strains)which estab-lished the method to detect the distribution of known SNP loci in the population of L.edodes.This method will be helpful for tracking the source of L.edodes strains and identifying the functional geneseasily,quickly,and accu-rately.

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期刊信息
  • 《菌物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国菌物学会
  • 主编:戴玉成
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路1号院3号中国科学院微生物研究所B401
  • 邮编:100101
  • 邮箱:jwxt@im.ac.cn
  • 电话:010-64807521
  • 国际标准刊号:ISSN:1672-6472
  • 国内统一刊号:ISSN:11-5180/Q
  • 邮发代号:2-499
  • 获奖情况:
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:5637