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基于叶绿体单倍型的山东丹参居群遗传结构分析
  • ISSN号:1000-4025
  • 期刊名称:西北植物学报
  • 时间:0
  • 页码:683-690
  • 语言:中文
  • 分类:Q346.5[生物学—遗传学]
  • 作者机构:[1]曲阜师范大学生命科学学院,山东曲阜273165
  • 相关基金:国家自然科学基金(30770145);教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-06-0609);山东博士基金(2007BS08020)致谢:感谢陈玉峰、刘瞳在采样过程中给予的无私帮助,同时感谢马永婷、陈玉霞、高翠等在实验过程中的热心指导.
  • 相关项目:稻属多倍体重复位点的基因表达差异研究
中文摘要:

依据叶绿体psbA-trnH基因间隔区的序列多态对来自山东地区丹参的3个自然居群和1个栽培居群进行了遗传结构研究。结果显示,80个供试材料中共有10种单倍型,核苷酸多样性为0.024,叶绿体DNA单倍型进化分支分析把10种单倍型分为2大支,但每支都由4个居群的单倍型共同构成;Nei多样性指数为0.284,Shannon信息指数为0.406,多态位点百分比率为70%;4个居群总基因多样性为0.905,居群内平均基因多样性指数为0.747,遗传分化系数为0.175;不同居群间的遗传分化系数为0.017~0.199,基因流为2.013~28.912;AMOVA分析揭示居群间只有5%的遗传差异。研究结果表明,山东丹参遗传多样性水平较高,但由于彼此较高的基因交流,居群间遗传分化水平低,仅有的遗传差异主要存在于居群内;另外,序列谱系关系分析表明山东栽培丹参来源复杂且具有丰富的遗传多样性。

英文摘要:

Based on the sequence polymorphism of chloroplast psbA-trnH intergenic spacer region, the genetic structure of 3 wild populations and 1 cultivated population of Salvia miltiorrhiza from Shandong Province was studied. The results indicated that a total of 10 haplotypes were discovered from 80 samples, and 0. 024 of nucleotide diversity were estimated. The cladogram of haplotypes classified 10 haplotypes into 2 major clusters,and each consisted of the haplotypes from 4 populations;Nei's gene diversity was 0. 284, Shannon's information index was 0. 406 ,and the percentage of polymorphic loci was 70%;the total genetic diversity was 0. 905 and the within-population diversity was 0. 747, interpopulation differentiation was 0. 175;between different population pair, the genetic differentiation ranged from 0. 017 to 0. 199 0, and gene flow ranged from 2. 013 to 28. 912;AMOVA revealed that 5 % of the total genetic variation was partitioned among populations. The results revealed a high level of genetic diversity but low level of genetic differentiation in S. rniltiorrhiza and confirmed that the genetic difference of the species existed mainly within population. In addition,the result also suggested that the cultivated S. miltiorrhiza of Shandong Province had complicated origin, and retained plentiful genetic diversity.

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期刊信息
  • 《西北植物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:西北农林科技大学 陕西省植物学会
  • 主编:赵忠
  • 地址:陕西杨陵邰城路3号西北农林科技大学
  • 邮编:712100
  • 邮箱:xbzwxb@vip.163.com
  • 电话:029-87082936
  • 国际标准刊号:ISSN:1000-4025
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1091/Q
  • 邮发代号:52-73
  • 获奖情况:
  • 全国优秀期刊,中国自然科学核心期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国生物科学数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:46104