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双翅目昆虫与脊椎动物内含子丢失和获得的比较分析
  • ISSN号:0454-6296
  • 期刊名称:昆虫学报
  • 时间:0
  • 页码:38-46
  • 语言:中文
  • 分类:Q963[生物学—昆虫学]
  • 作者机构:[1]湖北大学生命科学学院,武汉430062, [2]湖北师范学院生命科学学院,湖北黄石435002, [3]黄石理工学院化学与材料工程学院,湖北黄石435000
  • 相关基金:基金项目:国家自然科学基金项目(30871368;30870292)
  • 相关项目:人类Kenny-Caffey综合症果蝇模型的建立及致病基因TBCE的功能解析
作者: 金珊|
中文摘要:

内含子插入和丢失的进化动力及机制尚存有许多疑问。我们拟通过对真核生物的604个同源基因的蛋白高度保守区域内含子-外显子的结构研究,对人Homosapiens、大鼠Rattus norvegicus、小鼠Mus musculus、黑腹果蝇Drosophila melanogaster、冈比亚按蚊Anopheles gambiae和拟南芥Arabidopsis thaliana中的12585个内含子、3074个保守内含子进行分析,推断出不同系统中内含子进化趋势。结果显示在进化中双翅目昆虫丢失了约850多个内含子,脊椎动物获得了1600多个内含子,而双翅目昆虫获得的内含子及脊椎动物丢失的内含子则较少。在内含子分布上,除酵母有明显5′末端倾向性外,双翅目昆虫也显示出内含子分布倾向于基因的5′端,而在脊椎动物及拟南芥中则没有这种分布的倾向性。这可能是由于双翅目昆虫丢失的内含子大多位于基因的3′端造成的。通过对现在脊椎动物内含子分布及获得的内含子的插入相的研究,发现内含子的获得可能在一定程度上导致了现存基因的内含子中插入相0的内含子最多这一倾向。

英文摘要:

The mechanisms and evolutionary dynamics of intron insertion and loss in eukaryotic genes remain poorly known. A total of 604 protein-coding genes,which contain 12 585 introns and 3 074 conserved introns in distinct amino acid alignment sequences in orthologous genes from Vertebrata (Mus musculus,Rattus norvegicus and Homo sapiens),Diptera (Anopheles gambiae) and plant (Arabidopsis thaliana) were analyzed using systematic methods to assess the causes of present-day distribution of introns in different lineages. The results demonstrated that more than 850 introns lost in Diptera evolution and more than 1 600 introns gained in Vertebrata evolution,but the intron gain in Diptera evolution and intron loss in Vertebrata evolution are relatively less. Additionally,along with yeast,the distribution of introns in Diptera exhibits a bit more prevalent in the 5' end of genes,which was not found in vertebrates and plants. This may be due to intron loss mostly occurring in 3' end of genes in Diptera evolution. Meanwhile statistical results indicate that phase 0 intron is most common in the three species in Vertebrata,and this might be the consequence of that phase 0 intron was the most frequently gained intron type in evolution.

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期刊信息
  • 《昆虫学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国昆虫学会 中国科学院动物研究所
  • 主编:黄大卫
  • 地址:北京东中关村中国科学院动物研究所
  • 邮编:100101
  • 邮箱:kcxb@ioz.ac.cn
  • 电话:010-64807173 010-64807099
  • 国际标准刊号:ISSN:0454-6296
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1832/Q
  • 邮发代号:2-153
  • 获奖情况:
  • 国家期刊方阵“双百期刊”
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:16190