关于人类和动物肥大细胞的超微结构已有一些报道。不同进化水平的物种,其肥大细胞的超微和亚微结构具有种属差异性,而且即使在同一机体内,不同部位的肥大细胞其超微结构也可表现不同。在人的肺及胃黏膜中的大多数肥大细胞颗粒均具有独特的亚微结构,其由多个呈旋涡状排列的筒状结构组成,其余组织中的肥大细胞颗粒则主要呈电子致密均质状,前者仅含有类胰蛋白酶的T肥大细胞(MC^T);后者同时含类胰蛋白酶和类糜蛋白酶TC肥大细胞(MC^TC),这种结构特征可以作为区别两类不同表型肥大细胞的标志之一。