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拟诺卡氏菌线型质粒pNPL1的测序和分析
  • ISSN号:0253-2654
  • 期刊名称:《微生物学通报》
  • 时间:0
  • 分类:Q782[生物学—分子生物学]
  • 作者机构:[1]中国科学院上海生命科学研究院植物生理生态研究所合成生物学重点实验室,上海200032
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(No.31121001)
中文摘要:

【目的】检测和分析稀有放线菌中新的线型质粒。【方法】从植物内生菌中分离链霉菌之外的放线菌菌株,检测、测序和分析线型质粒。【结果】从中草药植物紫花前胡的叶片中分离到一株内生放线菌25L-1-1c,经过16S rRNA基因序列比对属于拟诺卡氏菌。从该菌株中检测到一个约25 kb的线型质粒pNPL1。克隆和测序了pNPL1新的端粒,含有多个小的回文序列。测序获得全长为24 621 bp的线型质粒pNPL1,预测编码22个基因,其中2个基因与链霉菌质粒的端粒复制基因同源,1个基因与链霉菌质粒主要的接合转移基因相似,其余19个基因为未知功能。携带pNPL1端粒复制基因的质粒不能转化变铅青链霉菌,暗示需要发展拟诺卡氏菌的遗传操作系统。【结论】这是首次在拟诺卡氏菌中发现和描述线型质粒。

英文摘要:

[Objective] To detect and analyze linear plasmids from rare actinomycetes species. [Methods] Rare actinomycetes strains were isolated from plants, and linear plasmids were detected, sequenced and analyzed. [Results] An endophytic actinomycetes strain 25L-1-1c was isolated from Chinese herb Peucedanum decursivum. Its 16S rRNA gene sequence resembled Nocardiopsis. Strain 25L-1-1c harbored a linear plasmid pNPL1. The telomere of pNPL1 was cloned and sequenced, which was a novel sequence containing multiple palindromes. The complete nucleotide sequence of pNPL1 comprised 24 621 bp, encoding 22 genes, 2 of them resembling Streptomyces telomere replication genes, one major plasmid transfer gene, and others unknown functional genes. Plasmid containing the Nocardiopsis telomere replication genes could not propagate in S. lividans, indicating that development of Nocardiopsis genetic system is needed. [Conclusion] This is the first example of linear plasmid in Nocardiopsis.

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期刊信息
  • 《微生物学通报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院微生物研究所 中国微生物学会
  • 主编:赫荣乔
  • 地址:北京市朝阳区北辰西路一号院3号中国科学院微生物研究所内B401室
  • 邮编:100101
  • 邮箱:xuj@sun.im.ac.cn
  • 电话:010-64807511
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-2654
  • 国内统一刊号:ISSN:11-1996/Q
  • 邮发代号:2-817
  • 获奖情况:
  • 1992年中国科学技术协会优秀学术期刊三等奖,1992年国家科委中共中央宣传部新闻出版署“全国优...,2000年中国科学院优秀期刊三等奖,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,美国剑桥科学文摘,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:29487