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液滴数字PCR芯片结果自动化读出平台的研究
  • ISSN号:1004-373X
  • 期刊名称:《现代电子技术》
  • 时间:0
  • 分类:TN911-34[电子电信—通信与信息系统;电子电信—信息与通信工程]
  • 作者机构:[1]上海大学量子与分子结构国际中心,上海201900, [2]中国科学院上海微系统与信息技术研究所,上海200050
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(21275153;61302052;61571428);上海市浦江人才项目(15PJ1409800)
中文摘要:

液滴数字聚合酶链式反应(ddPCR)作为第三代PCR技术,可实现核酸分子绝对定量。然而,在数字PCR结果读出过程中,对1000万量级的液滴进行统计费时费力而且容易出错。针对此情况设计了液滴数字PCR芯片的自动扫描识别平台,系统包括硬件移动平台和软件拍照、拼接和识别功能。软件控制平移台顺序移动并控制摄像头拍照,移动完成后把拍得的照片拼接成一张图片,之后对图片中的液滴进行识别。此平台通过二维平移台的精确定位扫描及图像分割、识别算法,对荧光和非荧光液滴识别率达到99.6%以上。平台已经应用到了实验室中,对数字PCR芯片上的微液滴可实现一键识别,极大的减小了识别时间和错误率。

英文摘要:

As the third generation PCR technique, the droplet digital PCR (ddPCR) can realize the absolute quantification for nucleic acid molecule, but in the process of PCR result readout, the statistics of ten-million magnitude droplets wastes time and manpower, and is easy to result in errors. Therefore, an automatic scanning and recognition platform of ddPCR chip was de- signed. The system includes the hardware mobile platform, and has the functions of software photographing, image splicing and droplet recognition. The sequential movement of the platform and photographing of camera are controlled by the software, and then the photographed pictures are spliced into a photograph to recognize droplets in it. The recognition rate of the platform for fluorescent and non-fluorescent droplets can reach up to above 99.6% by means of the accurate positioning and scanning, image segmentation and recognition algorithms of the 2D translation platform. This platform has been applied to the laboratory, can rec- ognize the microdroplets produced by digital PCR chip with one key, shorten the recognition time and reduce the recognition er- ror rate greatly.

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期刊信息
  • 《现代电子技术》
  • 北大核心期刊(2014版)
  • 主管单位:陕西省信息产业厅
  • 主办单位:陕西电子杂志社 陕西省电子技术研究所
  • 主编:张郁(执行)
  • 地址:西安市金花北路176号陕西省电子技术研究所科研生产大楼六层
  • 邮编:710032
  • 邮箱:met@xddz.com.cn
  • 电话:029-93228979
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-373X
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1224/TN
  • 邮发代号:52-126
  • 获奖情况:
  • 中国科技核心期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 波兰哥白尼索引,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:37245