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一种用于核酸高灵敏检测的液滴式数字聚合酶链式反应芯片
  • ISSN号:0251-0790
  • 期刊名称:《高等学校化学学报》
  • 时间:0
  • 分类:O655.9[理学—分析化学;理学—化学]
  • 作者机构:[1]传感技术国家重点实验室中国科学院上海微系统与信息技术研究所,上海200050, [2]中国科学院大学,北京100049
  • 相关基金:国家自然科学基金(批准号:81472751,61271162,61571428,61571429)、国家“九七三”计划项目(批准号2012CB933303)和上海市浦江人才计划项目(批准号:15PJl409800)资助.
中文摘要:

为了实现对核酸的高灵敏度检测,构建了一种新型的液滴式数字聚合酶链式反应(dd PCR)芯片.该芯片由产生液滴的聚二甲基硅氧烷(PDMS)模块和储存液滴的玻璃腔室构成.实验结果表明,该芯片可以在25 min内产生2×106个直径为20μm的微液滴(体积4.187 p L).利用该芯片定量检测了表皮生长因子受体(EGFR)基因第19号外显子,在DNA浓度为106~101copies/μL范围内呈现良好的线性关系(R2=0.9998);在浓度为106copies/μL的19号外显子野生型DNA中检测105~100copies/μL的突变型DNA,其检测敏感度可达到0.0001%.该方法在同一芯片上实现了液滴产生、核酸扩增和荧光信号读取的功能,在核酸绝对定量及痕量突变基因的检测中具有潜在应用前景.

英文摘要:

Sensitive and rapid quantification of nucleic acid is significant for clinical diagnosis and medication guide of tumor. In this study, we developed a novel droplet digital PCR(ddPCR) device for sensitive nucleic acid detection. This chip contains a PDMS chip and glass-made reservoir, which can overcome the problems of droplet evaporation and instability during PCR. The double droplet generation channels in this chip can produce 2×106 droplets(4. 187 pL each) in 25 min. For detecting EGFR exon 19 wild-type DNA using this ddPCR chip, it demonstrated a good linear correlation with the DNA concentration from 10 to 106 copies/μL (R2= 0. 9998). In addition, we show sensitive detection of EGFR exon 19 mutate DNA in a 106-fold excess of wild-type bac PCR process nucleic acids kground. In conclusion, this ddPCR chip integrates the functions of droplet generation, on-chip and fluorescence signals readout, which will provide a potential application in the absolute quantification and rare mutate gene detection.

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期刊信息
  • 《高等学校化学学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中华人民共和国教育部
  • 主办单位:吉林大学 南开大学
  • 主编:周其凤
  • 地址:吉林大学南胡校区
  • 邮编:130012
  • 邮箱:cjcu@jlu.edu.cn
  • 电话:0431-88499216
  • 国际标准刊号:ISSN:0251-0790
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1131/O6
  • 邮发代号:12-40
  • 获奖情况:
  • 首届及第二届国家期刊奖,连续两届“百种中国杰出学术期刊”,中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:50676