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澳洲野生稻(Oryza australiensis)内生固氮菌的分子鉴定及发育分析
  • ISSN号:1006-687X
  • 期刊名称:《应用与环境生物学报》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.11[生物学—微生物学] Q948.12[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]华南农业大学农学院,广州510642, [2]运城学院生命科学系,运城044000, [3]华南农业大学资源环境学院,广州510642
  • 相关基金:国家自然科学基金项目(31370052); 国家基础研究发展计划项目(2010CB126502); 广东省科技项目(2013B060400020,2012B010300018)资助.
中文摘要:

采用两种无氮培养基经平板划线法共分离筛选到澳洲野生稻(Oryza australiensis)45株内生固氮菌.利用全细胞蛋白电泳和插入序列指纹图谱对获得的内生固氮菌进行聚类分析,将其分为8个类群.其中类群Ⅰ有10株菌,类群Ⅱ为4株菌,类群Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ均为3株菌,类群Ⅵ、Ⅶ和Ⅷ各有2株菌.对分离得到的内生固氮菌主要类群部分代表菌株的固氮活性进行了系统研究,结果表明,菌株在偏酸(pH值5.0)和偏碱(pH值9.0)的条件下均能保持较高的固氮酶活性,NaCl浓度在2%时达到最高固氮活性,NH4+浓度达到7.5 mmol/L时,均无固氮酶活性,不同菌株所能利用的碳源不同.16S rDNA序列测定及系统发育分析显示:类群ⅠYH39与Burkholderia cepacia ATCC 25416T相似性为97%;类群Ⅱ为克雷白氏杆菌属(Klebsiella),相似性为100%;类群Ⅲ为泛菌属(Pantoea),相似性为99%;类群Ⅴ为草螺菌属(Herbaspirillum),相似性为99%;类群Ⅶ为中华根瘤菌属(Sinorhizobium),相似性为99%.本研究表明澳洲野生稻内生固氮菌资源具有遗传多样性.

英文摘要:

This research aimed to investigate the diversity of endophytic nitrogen-fixing bacteria in Oryza australiensis. Forty-five strains of endophytic diazotrophs were isolated from wild rice O. australiensis by using two selective nitrogen-free media, and analyzed for phylogenetic and nitrogen-fixing characteristics. The obtained endophytic nitrogen-fixing bacteria were divided into 8 clusters by using SDS-PAGE of whole-cell protein and IS-PCR fingerprinting. The strains were found to be able to maintain higher nitrogenase activity under acid(pH 5.0) or alkaline(pH 9.0) conditions. The highest nitrogen fixation activity occurred in 2% NaCl concentration. None of the strains showed nitrogenase activity at NH4+ of 7.5 mmol/L. Among the 8 clusters, Cluster Ⅰ had 10 strains, followed by 4 strains of Cluster Ⅱ, 3 of Clusters Ⅲ, Ⅳ and Ⅴ, and 2 of Clusters Ⅵ, Ⅶ and Ⅷ. The homology was 97% between Cluster Ⅰ and Burkholderia cepacia ATCC 25416 T, 99% between Cluster Ⅴ and Herbaspirillum seropedicae DX35 T(KF357956.1), 100% between Cluster Ⅱ and Klebsiella variicola CPB S30T(KF770986.1), 99% between Cluster Ⅲ and Pantoea agglomerans PB17T(EU360112.1), and 99% between Cluster Ⅶ and Sinorhizobium sp. T2T(FJ687994.1). The results suggested that endophytic nitrogen-fixing bacteria of O. australiensis have genetic diversity, with different strains being able to use different carbon sources.

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期刊信息
  • 《应用与环境生物学报》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国科学院成都生物研究所
  • 主编:吴宁
  • 地址:成都市人民南路4段9号
  • 邮编:610041
  • 邮箱:biojaeb@cib.ac.cn
  • 电话:028-82890917
  • 国际标准刊号:ISSN:1006-687X
  • 国内统一刊号:ISSN:51-1482/Q
  • 邮发代号:62-15
  • 获奖情况:
  • 中国农业期刊金犁奖学术类一等奖(2006),* 中国期刊方阵双效期刊(2002年),* 四川省第二届优秀期刊(2000年),* 四川省一级学术期刊(1998年)
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国生物科学数据库,英国动物学记录,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:23016