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线性聚丙烯酰胺凝胶毛细管电泳的迁移特性
  • ISSN号:0253-3820
  • 期刊名称:《分析化学》
  • 时间:0
  • 分类:O657.8[理学—分析化学;理学—化学] Q503[生物学—生物化学]
  • 作者机构:[1]浙江大学现代光学仪器国家重点实验室,浙江杭州310027, [2]福建师范大学物理与光电技术学院,福建福州350007
  • 相关基金:基金项目:本文系国家自然科学基金资助项目(No.60378042)
中文摘要:

使用线性聚丙烯酰胺作为筛分介质,对片段长度为80-584bp的标准DNA样品进行毛细管电泳,利用激光诱导荧光方法检测信号,荧光染料为溴化乙啶。改变电场强度100-375V/cm,得到的迁移率曲线与电场强度和DNA片段长度成复杂的函数关系,已有的经典理论模型:Ogston模型、Reptation无拉伸模型和Reptation拉伸模型都不能正确地描述实验观察到的迁移率随电场强度和DNA片段长度的变化情况。因此,提出一种修正的Ogston筛分理论,假定迁移的DNA分子在电场强度方向延展拉伸,如同小分子穿过凝胶筛孔。在该修正模型中,DNA的迁移率仅依赖于电场强度、筛分介质浓度和片段长度,很好地解释了实验现象。

英文摘要:

Capillary electrophoresis of DNA fragments ( from 80 bp to 584 bp) in replaceable linear polyacryl-amide (LPA) solution was investigated using laser induced fluorescence detection. The fluorescence dye was ethidium bromide (EB). When the electric field strength was changed from 100 V/cm to 375 V/cm, the mobility was varied as a complex function of fragment size and electric field. The classic theory models of Ogston and Reptation did not work well here. A modified Ogston model for LPA sieving medium was presented. It assumes that the applied electric field in conjunction with the gel matrix distorts the DNA, altering the effective size of the migrating molecule. The stretched DNA offers a smaller cross-section to the gel pore and thus sieves like a smaller molecule. In this model, the electrophoresis mobility depends only on the applied electric field strength, the concentration of gel matrix and the size of the fragment. The modified Ogston equation accurately predicts the mobility of DNA fragments in various electric fields, providing a single simple model to account for all of the observed behavior.

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期刊信息
  • 《分析化学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国化学会 中国科学院长春应用化学研究所
  • 主编:杨秀荣
  • 地址:长春市人民大街5625号
  • 邮编:130022
  • 邮箱:fxhx@ciac.ac.cn
  • 电话:0431-85262017
  • 国际标准刊号:ISSN:0253-3820
  • 国内统一刊号:ISSN:22-1125/O6
  • 邮发代号:12-6
  • 获奖情况:
  • 1999获首届国家期刊奖,2000年获中国科学院优秀期刊特别奖,2001年入选中国期刊方阵“双高”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国乌利希期刊指南,美国剑桥科学文摘,美国科学引文索引(扩展库),日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:52455