位置:成果数据库 > 期刊 > 期刊详情页
DNA分析仪的灵敏度分析
  • ISSN号:1004-4213
  • 期刊名称:《光子学报》
  • 时间:0
  • 分类:TH74[机械工程—光学工程;机械工程—仪器科学与技术;机械工程—精密仪器及机械] TP391[自动化与计算机技术—计算机应用技术;自动化与计算机技术—计算机科学与技术]
  • 作者机构:[1]浙江大学国家光学仪器工程技术研究中心,浙江杭州310027, [2]福建师范大学物理与光电信息科技学院,福建杭州350007
  • 相关基金:国家自然科学基金资助项目(60378042)
中文摘要:

在DNA荧光测序中,噪声影响分析的准确度和检出限。相比其他滤波方法,小波分析具有良好的时频域分辨特性。在小波去噪处理中,正确选择合适的小波基函数和去噪阈值直接关系到信号去噪处理的质量。通过对毛细管电泳(CE)荧光信号的仿真分析,结果表明:选择sym7小波基函数、分解层数(1ev=5)与使用软阈值,可以有效去除CE荧光光谱信号的噪声,提高分析准确度。将其用于处理实际的DNA电泳荧光信号,效果良好。

英文摘要:

Fluorescence signals in DNA sequencing are often contaminated by noise, which has negative influence on the accuracy and detection limit of analysis. Wavelet analysis has excellent time and frequency domain resolution for signal denoising comparing with other filtering methods. Before the signals denoising process, a key problem is how to choose a suitable wavelet base and denoising threshold, which have great influences on the quality of signals denoising. Through the simulation analysis of capillary electrophoresis (CE) fluorescence signals, the results indicate that using sym7 wavelet base, decomposition level at 5 and using soft threshold can effectively reduce the noise of CE fluorescence signals and enhance the accuracy of analysis. When it is applied to DNA CE experimental signal, the results are also satisfactory.

同期刊论文项目
同项目期刊论文
期刊信息
  • 《光子学报》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中国科学院
  • 主办单位:中国光学学会 西安光机所
  • 主编:侯洵
  • 地址:西安市高新区新型工业园信息大道17号47分箱
  • 邮编:710119
  • 邮箱:photo@opt.cn
  • 电话:029-88887564
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-4213
  • 国内统一刊号:ISSN:61-1235/O4
  • 邮发代号:52-105
  • 获奖情况:
  • 中文核心期刊,曾获中国光学学会先进期刊奖,中国科学院优秀期刊三等奖,陕西省国防期刊一等奖等
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),波兰哥白尼索引,荷兰文摘与引文数据库,美国工程索引,美国剑桥科学文摘,英国科学文摘数据库,日本日本科学技术振兴机构数据库,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2004版),中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版),英国英国皇家化学学会文摘,中国北大核心期刊(2000版)
  • 被引量:20700