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深县猪保种群遗传多样性简化监测方法研究
  • ISSN号:1671-7236
  • 期刊名称:《中国畜牧兽医》
  • 时间:0
  • 分类:S813.3[农业科学—畜牧学;农业科学—畜牧兽医]
  • 作者机构:[1]河北农业大学动物科技学院, 保定071000, [2]国家北方山区农业工程技术研究中心,保定071000, [3]河北省山区农业工程技术研究中心,保定071000, [4]辛集市正农牧业有限公司,辛集050000
  • 相关基金:河北省现代农业产业技术体系专项(HBCT2013070202); 河北省大学生创新创业训练计划项目(201610086028); 河北农业大学大学生创新创业训练计划项目(20160401);
中文摘要:

为建立深县猪种群多样性监测的简化指标体系,试验采集河北省深县猪4个世代179头猪样本,采用联合国粮农组织和国际动物遗传协会联合推荐的27个微卫星标记进行群体遗传多样性分析,对27个微卫星标记进行两阶段、多梯度抽样,并根据抽样群体和总群体的多态信息含量(PIC)值的变化确定适宜抽样微卫星位点数,再以4个世代样本进行验证。结果表明,选取8个微卫星位点时与全部位点的比较相对偏差可控制在5%以内,且以各分世代的验证比较相对偏差在10%左右,通过比较确定以S0155、S0228、SW632、S0090、CGA、S0101、S0227、SW122这8个微卫星位点构成的简化指标体系可较好地反映深县猪种群遗传多样性的变化。因此,深县猪的保种群群体遗传多样性监测可以简化为检测这8个微卫星位点,同时本研究采用的方法也可为其他保种群的遗传多样性监测方法的简化处理提供参考。

英文摘要:

In order to establish a simple detecting index system for the genetic diversity of Shen-xian pig population,179 samples in 4 generations of Shenxian pigs were collected,and the population genetic diversity were detected using 27 microsatellite markers which were jointly recommended by the Food and Agriculture Organization of the United Nations( FAO) and the International Society for Animal Genetics( ISAG). 2-stage and multi-gradient sampling were conducted to the 27 microsatellite markers. The suitable number of microsatellite loci was determined according to the comparation of the polymorphic information content( PIC) of the sampled groups and total population,then validated with 4 generations of samples. The results showed that the relative deviation value PIC of eight microsatellite markers was no more than 5% comparing with all markers,and the relative deviation was about 10% in the different generations. 8 microsatellite markers including S0155,S0228,SW632,S0090,CGA,S0101,S0227 and SW122 constituted the final simplified index system,which could represent the changes of genetic diversity in Shenxian pig conservation population. Therefore,the genetic diversity monitoring of the population of Shenxian pig could be simplified to detect the eight microsatellite markers. At the same time,the methodused in this study could also provide a reference for the simplified treatment of genetic diversity monitoring methods.

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期刊信息
  • 《中国畜牧兽医》
  • 中国科技核心期刊
  • 主管单位:中华人民共和国农业部
  • 主办单位:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 主编:李琍
  • 地址:中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
  • 邮编:100193
  • 邮箱:zgxmsy@caas.cn
  • 电话:010-62816020 62811226 62810371
  • 国际标准刊号:ISSN:1671-7236
  • 国内统一刊号:ISSN:11-4843/S
  • 邮发代号:2-215
  • 获奖情况:
  • 1996年被农业部评为“95中国出版成就展”参展期刊...,1998年在首届全国畜牧兽医优秀科技期刊评比中总分...,2002年被中国期刊协会农业期刊分会和中国农学会评...
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:22619