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利用RAPD和ILP技术筛选橡胶树抗寒分子标记
  • ISSN号:1674-568X
  • 期刊名称:基因组学与应用生物学
  • 时间:2014.2.28
  • 页码:145-152
  • 分类:Q943[生物学—植物学]
  • 作者机构:[1]中国热带农业科学院橡胶研究所,农业部橡胶树生物学与遗传资源利用重点实验室,儋州571737
  • 相关基金:中国热带农业科学院院本级基本科研业务费专项“橡胶树分子标记开发及应用”(1630022013028); 国家自然基金“橡胶树排胶相关ADF基因参与乳管堵塞的机制研究”(31200514); 海南省自然科学基金“肌动蛋白解聚因子与橡胶树死皮的关系研究”(311087)共同资助 致谢 感谢国家橡胶树种质资源圃为本研究提供橡胶树种质材料.
  • 相关项目:橡胶树排胶相关ADF基因参与乳管堵塞的机制研究
作者: 邓治|李德军|
中文摘要:

利用36个RAPD引物和7对ILP引物分别分析30份抗寒性差异的橡胶树种质DNA的多态性。结果显示7个RAPD引物扩增产物中出现9种多态性片段,回收并测序多态性片段,Blast比对结果表明其中6种片段为未知序列,其余3种片段HbR4PF、HbR6PF和HbR1+4PF分别与烟草冷胁迫cDNA文库差异表达基因、反转录转座子和橡胶树contig1323727序列同源。采用半定量RT-PCR分析HbR6PF表达模式,结果表明低温能调控HbR6PF基因的表达。在7对ILP引物中,只有抗坏血酸抗氧化物酶ILP引物扩增产物出现多态性条带,但该条带在抗寒和不抗寒种质中同时出现,说明该ILP标记不能用于区分抗寒和不抗寒种质。

英文摘要:

15 cold-resistant and 15 cold-sensitive Hevea germplasm were analyzed by PCR with 36 RAPD primers and 7 ILP primer pairs. Among 36 RAPD primers, 7 RAPD primers indicated 9 polymorphic bands with 30 Hevea germplasm. All the polymorphic bands were cloned and sequenced, and the alignment results showed that the sequences amplifying from HbR4PF, HbR6PF and HbR1 +4PF were separately homologous with the Nico- tiana tabacum cDNA sequences from cold overnight library, retrotransposon protein and Hevea brasiliensis contig sequence, whereas the other 6 fragments didn't return homologous sequences from GenBank. In addition, the semi-quantitative RT-PCR analyses showed that the expression of HbR6PF was regulated by low temperature. Of 7 ILP primer pairs, only the one developed from ascorbate peroxidase indicated polymorphic bands with 30 Hevea germplasm, but the polymorphic bands were present in cold-resistant and cold-sensitive Hevea germplasm. The result showed that the ILP marker couldn't be used to distinguish between cold-resistant germplasm and cold-susceptible germplasm in Hevea brasiliensis.

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期刊信息
  • 《基因组学与应用生物学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广西大学
  • 主办单位:广西大学
  • 主编:朱玉贤
  • 地址:广西南宁市大学东路100号广西大学西校园《基因组学与应用生物学》编辑部111室
  • 邮编:530004
  • 邮箱:gab@hibio.org 571388455@qq.com
  • 电话:0771-3239102
  • 国际标准刊号:ISSN:1674-568X
  • 国内统一刊号:ISSN:45-1369/Q
  • 邮发代号:48-213
  • 获奖情况:
  • 全国优秀高校学校自然科学学报,教育部优秀科技期刊,广西优秀科技期刊,中国期刊方阵“双效”期刊
  • 国内外数据库收录:
  • 俄罗斯文摘杂志,美国化学文摘(网络版),英国农业与生物科学研究中心文摘,美国剑桥科学文摘,英国动物学记录,中国中国科技核心期刊,中国北大核心期刊(2011版),中国北大核心期刊(2014版)
  • 被引量:4299