目的对1990年1月~2012年12月中国期刊数据库(CNKI)收录的肿瘤中医证候的相关分子研究的文献,通过频度分析总结中医证候和相关分子特点,以探讨肿瘤证候相关分子内涵。方法对所选文献中的证候、相关分子进行统计归类和频数分布分析;用BioProfiling.de网站进行分子生物信息分析。结果归类后得到27个证候,气滞血瘀、脾气虚、痰浊中阻、气阴两虚、阴虚燥热、湿热互结为常见证候,占68.42%;在证候要素中归纳出9个要素,实性证候要素占64.88%,主要有气滞、血瘀、痰结、热毒占59.52%;虚性证候要素占35.12%;27个证候中共涉及39个相关分子;痰证相关分子有EGFR、Ki67、TFF1;瘀证相关分子有:CA199、CEA、CA242等;虚证相关分子有:EGFR、CerbB2、Ki67、VEGF。结论肿瘤中医证候相关分子的数据挖掘可为进一步研究肿瘤证候分子内涵提供依据。