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贺兰山两株大型真菌物种分子鉴定与系统地位分析
  • ISSN号:1004-874X
  • 期刊名称:《广东农业科学》
  • 时间:0
  • 分类:Q939.11[生物学—微生物学]
  • 作者机构:[1]包头师范学院生物科学与技术学院,内蒙古包头014030, [2]内蒙古农业大学林学院,内蒙古呼和浩特010018
  • 相关基金:国家自然科学基金(31260132,31060111);内蒙古自然科学基金(2012MS0514)
中文摘要:

采用CTAB法对采集于贺兰山地区的两株野生大型真菌子实体进行基因组DNA提取,并利用真菌特有引物ITS1F和ITS4,在PCR基础上对其rDNA的ITS区段进行碱基序列测定,并与GenBank数据库中已知的相关序列进行Blast比对,结果表明,两株野生大型真菌分别属于鳞伞属(Pholiota sp.)和球盖菇属(Stropharia sp.),GenBank登录号分别为FJ596817.1和JQ627593.1.同时在UNITE Database(s)数据库中采用邻接法对两菌株进行系统发育树的构建及遗传距离的计算,结果表明,一菌株与Pholiota tuberculosa (Pers.) Kuyper & Tjall.-Beuk (UDB015324),另一菌株与Stropharia coronilla (Fr.ex Bull.) Quél.(UDB015429及UDB015556)的遗传关系最近,遗传距离达到5.0.初步鉴定两株野生大型真菌为小瘤鳞伞和齿环球盖菇.

英文摘要:

The extraction of genomic DNA of two wild macrofungi obtained from Wulashan was carried out by CTAB method. Then, on the basis of PCR, ITS regions of DNA of the macrofungi were amplifiedby using the special pairs of primers ITS 1 F/ITS4 and sequenced. The sequences were compared with those registered in GenBank database, results of which showed that two fungi belonged to the genus Pholiota sp. and Strophariaceae sp .. Genbank accession numbers of the ITS gene was FJ596817.1 and JQ627593.1. Then the phylogenetic trees were constructed by neighbor-joining method and genetic distance was analyzed in UNITE Database (s). The results showed that two wild fungi had a high genetic distance, one with Pholiota tuberculosa (Pers.) Kuyper & Tjall.-Beuk (UDB015324), and the other with Strop haria coronilla (Fr. ex Bull.) Quel.(UDB015429, UDB015556), which was up to 5.0. On the basis of the sequence analysis, two wild fruiting bodyforming fungi were identified as PhoZiota tuberculosa and Strop haria coronilla.

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期刊信息
  • 《广东农业科学》
  • 北大核心期刊(2011版)
  • 主管单位:广东省农业科学院
  • 主办单位:广东省农业科学院 华南农业大学
  • 主编:
  • 地址:广州市天河区金颖路31号五山广东省农科院农经所
  • 邮编:510640
  • 邮箱:gdnykx@vip.163.com
  • 电话:020-38319948 38319941 38319942 38319946
  • 国际标准刊号:ISSN:1004-874X
  • 国内统一刊号:ISSN:44-1267/S
  • 邮发代号:
  • 获奖情况:
  • 广东省第二、第三届优秀科技期刊,广东省首届十佳期刊,中国期刊方阵“双效”期刊,第四届全国农业优秀期刊一等奖,第五届全车优秀农业期刊鑫犁奖一等奖,首届全国CAD规范一等奖
  • 国内外数据库收录:
  • 美国化学文摘(网络版),英国动物学记录,中国北大核心期刊(2008版),中国北大核心期刊(2011版)
  • 被引量:33995